Verktyg

LifeWatch utvecklar webbtjänster för dataflöden och virtuella laboratorier för analys av biodiversitetsdata. Här är de verktyg och tjänster som har utvecklats inom eller i samarbete med LifeWatch:

Analysportalen.PNG

Analysportalen

Analysportalen erbjuder ett enkelt och smidigt sätt att nå alla data i Svenska LifeWatch – här kan man söka, filtrera, visualisera och ladda hem data från alla de datakällor som ingår i e-infrastrukturen.

 

BioVeL.jpg

BioVeL

BioVeL tillhandahåller e-laboratorier för att analysera stora datamängder med hjälp av virtuella arbetsflöden. Skapa egna flöden eller sök i BioVeLs bibliotek efter befintliga arbetsflöden att återanvända.

Dinophysis-acuta_Bengt_Karlson.jpg

Nordic Microalgae

Webbsidan nordicmicroalgae.org innehåller information om mikroalger och besläktade organismer i Norden och närliggande områden. Den geografiska utbredningen omfattar Östersjön, nordöstra delen av Atlanten och sjöar och vattendrag i området. Webbplatsen ska fungera som en resurs inom forskning, undervisning och miljöövervakning och det är i huvudsak användarna som tillhandahåller innehållet.

plankton_toolbox_collage.jpg

Plankton Toolbox

Plankton Toolbox är ett analysverktyg för planktondata som utvecklas av SMHI. Programvaran kan laddas ner utan kostnad och finns för både MacOS och Windows. Plankton Toolbox är ett verktyg för forskare inom det akvatiska området och anra som arbetar med planktondata. Programmet gör det enklare att arbeta med stora dataset kring diversitet, abundans, biovolym, etc.  

DynTaxa_Dyntaxabild.jpg

Dyntaxa

All systematik inom Svenska LifeWatch hanteras av Dyntaxa. Dyntaxa är en taxonomisk databas över Sveriges naturligt förekommande organismer, med information om svenskt namn, vetenskapligt namn, synonymer, klassificering, m.m. Dyntaxa utvecklas och förvaltas av ArtDatabanken vid SLU.

dna-nyckeln.jpg

Svenska DNA-nyckeln

Hjälp till artbestämning av svenska arter med DNA. Med DNA-nyckelns sökverktyg kan man göra likhetssökningar mellan en okänd DNA-sekvens och ett stort antal sekvenser lagrade i ett antal databaser. Naturhistoriska riksmuseet bygger upp den svenska DNA-nyckeln.

Publicerad: 04 juli 2016 - slu.se