Flygbildsinventeringen sker genom att man avgränsar homogena områden genom stereobetraktning av IR-flygbilder. Avgränsningen sker i så stor uträckning som möjligt utifrån tydliga gränser i naturen. Därefter beskrivs varje objekt med avseende på viktiga marktäckeparametrar.
Inventeringsarbetet innehåller följande moment:
Utifrån de variabler som registreras vid tolkningen är det sedan möjligt att göra olika typer av klassningar enligt den så kallade a-posteriori-principen. Det är alltså möjligt att utifrån NILS-variabler i efterhand utföra många olika typer av marktäckeklassificeringar utifrån användarnas önskemål.
Uppgifterna registreras i olika GIS-skikt i NILS databas. Separata GIS-skikt finns för ytor (t ex olika markslag, sjöar och öar), punktobjekt (t ex åkerholmar och stenrösen) och linjeobjekt (t ex vägar och diken).
Externa databaser nyttjas vid tolkningen där aktualitet, innehåll och noggrannhet motsvarar de krav som ställs inom NILS. Lantmäteriets Grundläggande Geografiska Data (GGD), Geografiska Sverigedata (GSD) och Lantmäteriets Fastighetskarta används antingen direkt, eller som stöd, vid tolkningen av byggnader, vägar och vattendrag.