Sveriges lantbruksuniversitet
Swedish University of Agricultural Sciences
Sveriges lantbruksuniversitet
Swedish University of Agricultural Sciences

Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi

 
Sveriges lantbruksuniversitet
Swedish University of Agricultural Sciences

Geomikrobiologi

Vi utforskar hur mikroorganismer (svampar och bakterier) bryter ned mineraler och vad det får för konsekvenser för interkationer med växter och ekosystemets näringscykling.

Genom att utnyttja naturliga laboratorier ute i fält, där växter har interagerat med mikroorganismer, undersöker vi samhällsuppbyggnaden hos mikroorganismer, anpassning av arter till olika miljöer, funktionell diversitet och evolution. De här naturliga laboratorierna hittar vi ofta i näringsfattiga, ostörda barrskogar, men även i barrskog som har brukats intensivt t ex i  ‘Evolution Canyon’ i Israel, Mt. Lemmon i Arizona, USA, the Angelo Coast Range Reserve i California, USA och Point Reyes National Seashore i Californien, USA. 

  

Mikroskopbild av svamphyfer som växer på flourapatit (foto av Anna Rosling).

Genom att undersöka mikroorganismerna i deras naturliga miljö är det möjligt att skapa modeller som kan ge praktiska lösningar på globala problem, t ex brist på mineraltillgångar och utarmade jordar.

Vi tar även observationerna ute i naturen ett steg länge och undersöker dem i mikrokosmer i laboratoriemiljö. Där kan vi isolera en eller flera organismer och undersöka dem under förhållanden som liknar de ute i fält. På det här viset blir det möjligt att studera mikrob- växt- och mineralinteraktioner på molekylär nivå under kontrollerade former. Vi använder de senaste molekylära metoderna för att analysera mikrobiella samhällen och funktionella genuttryck samt har tillgång till mikroskop med extremt hg upplösning.

Personal

Roger Finlay (Professor)
Anna Rosling (Forskare)
Salme Timmusk (Forskare)
Shahid Mahmood (Postdoktor)

 


Pågående projekt


Microbial communities colonising bedrocks – their role in biogeochemical cycling of nutrients in Swedish forests
(Shahid Mahmood, Roger Finlay)

Small-scale fungal community composition throughout soil profiles on contrasting parental material at Point Reyes National Sea Shore, CA, USA.
(Nick Rosenstock and Anna Rosling)

Bacterial distribution in the rhizosphere of wild progenitors of cereals (wild barley, emmer wheat) at the ‘Evolution Canyon’, Israel
(Salme Timmusk)

Ecological life strategies of soil microorganisms determined by analyzing microbial community composition in relation to soil biogeochmical processes over natural rain fall cycles.
(Anna Rosling, Karelyn Cruz, Jill Banfield)

Functional diversity of ‘active’ ectomycorrhizal mycelial networks and associated bacterial communities involved in granite weathering
(Shahid Mahmood, Roger Finlay)

Functional diversity of the ponderosa pine colonizing microorganisms at Mt. Lemmon, Arizona
(Salme Timmusk)

Functional diversity of ectomycorrhizal fungi and bacteria colonizing different mineral soil profiles
(Anna Rosling, Bin Lian and Sara Holmström)

Elevated nitrogen inputs – their impact on microbe-mineral-plant interactions and nutrients mobilization
(Shahid Mahmood, Catarina Martins, Jim Prosser, Roger Finlay)

The role of ACC deaminase containing bacteria in phosphorus solubilization at ‘Evolution Canyon’ and Mt. Lemmon Arizona
(Salme Timmusk)

The effect of elevated CO2 on weathering by pine seedlings colonized by ectomycorrhzial fungi.
(Nick Rosenstock and Anna Rosling)

Gene regulation of induced Goethite weathering in the dry root fungi Serpula lacrymans grown on carbon sources of different complexity.
(Anna Rosling, Nils Högberg, Jan Stenlid)

 

MÖTEN OCH AKTIVITETER

CZEN – Critical Zone Exploration Network

SIG Geomycology at IMC9 in Edinburg

Special interest issue of Fungal Biology Reviews

Kaktus som växer i en klippskreva (foto av Salme Timmusk).


PUBLIKATIONER

The role of fungi in biogenic weathering in boreal forest soils. 2009. Finlay et al. Fungal Biology Reviews 23: 101-106.

Oxalate and ferricrocin exudation by the extramatrical mycelium of an ectomycorrhizal fungus... 2005. van Hees et al. New Phytologist 169: 367-378.

Trees, mycorrhiza and minerals - field relevance of in vitro experiment. 2009. Rosling. Geomicrobiology Journal 26: 389-401.

 Carbon allocation to ectomycorrhizal roots and mycelium colonising different mineral substrates. 2004. Rosling et al. New Phytologist 162: 795-802.

Vertical distribution of ectomycorrhizal fungi in a podzol profile. 2003. Rosling et al. New Phytologist 159: 775-783.

Colonisation of spruce roots by two interacting ectomycorrhizal fungi... 2003. Mahmood. FEMS Microbiology Letters 221: 81-87.

Effects of hardened wood ash on microbial activity, plant growth and nutrient uptake.. 2003. Mahmood et al. FEMS Microbiology Ecology 43:121-131.

Elemental composition of ectomycorrhizal mycelia identified by PCR-RFLP analysis... 2003. Wallander et al. FEMS Microbiology Ecology 44: 57-65.


Sök efter fler PUBLIKATIONER

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Sidan uppdaterad: 2012-03-06. Sidansvarig: cajsa.lithell@slu.se
 

Fakulteten för naturresurser och lantbruksvetenskap • nlfak@slu.se  
Box 7082, 750 07 Uppsala • Tel. 018 67 10 00  •  Org.nr: 202100-2817