Respirationsmätningar på tallbarr under nedbrytning av svampen flåhätta, Mycena epipterygia (foto av Johanna Boberg). Läs mer här!

Organiska makromolekyler i ekosystemen bryts ned av extracellulära enzymer som produceras av mikroorganismer. För att förstå hur produktionen av dessa nedbrytningsenzymer regleras av mikroorganismernas abiotiska och biotiska miljö, behöver vi identifiera vilka mikroorganismer som är aktiva nedbrytare och öka vår kunskap om deras genetik och ekofysiologiska egenskaper.

Med det övergripande målet att bättre förstå reglering av kollagring, näringsomsättning och ekosystemproduktion, studerar vi hur mikroorganismer interagerar med ved, förna, skörderester och organiskt material i marken. Sekvensering av mikrobiella genom- och genuttrycksstudier identifierar mekanismer bakom nedbrytning i olika substrat. Svamparnas unika förmåga att transportera resurser i sina mycel har en avgörande inverkan på nedbrytning av organiskt material. I boreala och arktiska ekosystem undersöker vi i vilken utsträckning ektomykorrhizasvampar kan transportera socker från levande rötter för att driva nedbrytning av humusföreningar i marken. Vi bedriver även forskning om nedbrytning av skörderester i relation till växtskydd och uthållig matproduktion i utvecklingsländer.

Nedbrytningsprocesser studeras i laboratoriesystem såväl som direkt i fält. Några metoder som vi använder är: analys av stabila isotoper (13C och 15N), 14C-datering av organiskt material, enzymaktivitetsanalys, DNA-baserad analys av mikrobiella samhällen med hjälp av 454-sekvensering och qPCR, samt genom- och genuttrycksstudier.

Pågående projekt:

Competition between the mycorrhizal and saprotrophic fungal communities of boreal forest soils - Erica Sterkenburg, Karina Clemmensen, Roger Finlay & Björn Lindahl

Decomposition of fungal mycelium in boreal forest soil - Petra Fransson, Björn Lindahl, Shahid Mahmood & Roger Finlay

Factors behind soil quality in coniferous forests - Marianne Clarholm, Björn Lindahl, Anna Rosling

Functional ecology of rice straw decomposition - Do Thi Xuan, Nils Högberg, Anna Rosling, Sadhna Alström

Functioning of litter decomposing fungi in carbon and nitrogen circulation in boreal forests - Johanna Boberg, Jan Stenlid, Roger Finlay & Björn Lindahl

Fungal peroxidases involved in the degradation of recalcitrant organic matter in boreal forest ecosystems - Inga Bödeker, Karina Clemmensen, Åke Olson & Björn Lindahl

Fungal successions in a long-term boreal forest chronosequence - Karina Clemmensen, Björn Lindahl, Anders Dahlberg, Jan Stenlid & Roger Finlay

The effect of composts amended with a biocontrol agent on microbial community in rambutan - Do Thi Xuan, Nils Högberg, Anna Rosling,  Sadhna Alström

The Serpula lacrymans genome project - Nils Högberg, Anna Rosling & Jan Stenlid

Tree-fungi-soil interactions in the subarctic-alpine forest-heath ecotone - Karina Clemmensen & Björn Lindahl

Saprotrophic growth of plant pathogens - Hanna Friberg

Succession of wood-inhabiting fungal communities in decaying Norway spruce logs - Elisabet Eriksson, Ariana Kubartóva, Anders Dahlberg & Jan Stenlid

Successional changes of microbial communities in compost ecosystems - Nils Högberg

Wood decaying fungi in boreal forests: communities and activity - Ariana Kubartóva,  Elisabet Eriksson, Anders Dahlberg &  Jan Stenlid