Jämförande genomik inom släktet Serratia

Fyra isolat av Serratia sp. som isolerats från raps och fräken helgenomsekvenseras inom detta projekt. Bakterierna har visat sig vara tillväxtbefrämjande hos raps och de har även en hämmande effekt på växtpatogener då det studerats i fält- och växthusförsök. Här studeras dessa effekter ur ett genomperspektiv i samarbete med Joint Genome Institute, Department of Energy, USA. Genuttryck av interaktioner mellan bakterierna och växtpatogener studeras med hjälp av storskalig sekvensering.

Bakterier från släktet Serratia som växer på agarplattor (foto av Saraswoti Neupane). 

Vi arbetar med projektet:

Nils Högberg (kontaktperson)
Sadhna Alström (kontaktperson)
Roger Finlay
Björn Andersson
Saraswoti Neupane
Externt samarbete: JGI