Sveriges lantbruksuniversitet
Swedish University of Agricultural Sciences
Sveriges lantbruksuniversitet
Swedish University of Agricultural Sciences

Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi

 
Sveriges lantbruksuniversitet
Swedish University of Agricultural Sciences

Genomevolution

Studien av genomevolution kan handla om strukturell analys av ett genom (varför genomet har en viss storlek, genernas innehåll etc), varför det finns flera uppsättningar av vissa gener samt jämförande genomik mellan olika individer eller arter.

Rotröta (Heterobasidion annosum) är den mest destruktiva patogenen i barrskogar på norra halvklotet. Den är användbar inom genomevolutionsforskning eftersom den har ett förhållandevis litet genom (foto av Jonàs Oliva). 

Vi använder arter från Heterobasidion-artkomplexet (rotrötesvampar) som modellorganismer för detta arbete. Moderna sekvenseringsmetoder, i kombination med rotrötesvamparnas förhållandevis små genom, gör att vi kan kartlägga ett stort antal individer och närbesläktade arter. Därefter undersöker vi hur och varför DNA-sekvenser förändras över tiden.  

Personal:

Mikael Brandström Durling (PhD, kontaktperson)
Kajsa Himmelstrand (doktorand)
Nils Högberg (PhD)
Magnus Karlsson (PhD)
Jan Stenlid (professor)

 

LÄNKAR

SCATA - Ett verktyg som analyserar sekvenserat material från mikrobiella samhällen

JGI (the Joint Genome Institute)

Rotrötans genom 


 Sök efter PUBLIKATIONER

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Sidan uppdaterad: 2012-03-06. Sidansvarig: cajsa.lithell@slu.se
 

Fakulteten för naturresurser och lantbruksvetenskap • nlfak@slu.se  
Box 7082, 750 07 Uppsala • Tel. 018 67 10 00  •  Org.nr: 202100-2817