Svampar i artkomplexet Heterobasidion annosum är vanliga patogener som orsakar rot och utan röta i planterade barrträdsbestånd och naturskogar på hela norra halvklotet.

Fruktkropp av rotröta (Heterobasidion sp.) Foto av Jonàs Oliva.

Inom flera genomprojekt studerar vi rotrötans evolutionära historia och biologi, däribland utveckling, parning mellan isolat och sekundära metabolism. Genometprojekt ger oss möjlighet att identifiera sjukdomsframkallande faktorer och få insikter om mekanismerna bakom interaktionerna med värdenträden. Den ökade kunskapen om rotröta kommer att hjälpa oss att på ett effektivt sätt kontrollera sjukdomen.

Personal:

Jan Stenlid, Prof. 
Åke Olson, Ph.D.
Magnus Karlsson, Ph.D.
Mårten Lind, Ph.D.
Mikael Brandström-Durling, Ph.D.
Karl Lunden, Ph.D.
Eddy Vélëz, Ph.D.
Kerstin Dalman, Ph.D.
Kajsa Himmelstrand, Doktorand

Våra projekt: 

• Kartläggningen av genomet hos Heterobasidion irregularis i samarbete med ett internationellt konsortium. Kartläggningen utförs på JGI (the Joint Genome Institute). En version av genomet finns redan tillgängligt.

• Heterobasidion annosum studeras genom ett stort sekvenseringsprojekt där 23 individer har analyserats med hjälp av Solexa teknik. Evolutionär historia och aspekter av arvsmassans utveckling kommer att analyseras.

• Andra arter i artkomplexet som vi kommer att sekvensera hela genomet på inkluderar H. occidentale, H. parviporum och H. abietinum.