SVAMPDETEKTION
Genom att använda såväl klassisk taxonomi samt molekylär identifiering studerar vi svampsamhällen i en rad olika substrat. Sammansättningen av dessa samhällen är en central faktor för ekosystemfunktionen.
Infekterade tallbarr i Storbrittanien. Orsaken är den patogena svampen Dothistroma som ännu inte är ett problem i Sverige (Foto: Hanna Millberg).
Vår kompetens omfattar samhällsstrukturen av patogena svampar samt svampsamhällen i skogar, träd, död ved,förna och skörderester. Traditionellt sett har morfologisk taxonomi använts för att identifiera arter och beskriva svampsamhällen. Även om vår institution har haft en hög kompetens inom detta område, så bygger morfologisk taxonomi i många fall på produktionen och detektionen av svampens fruktkroppar och kan ge en ofullständig bild av mångfalden av arter. I allt högre grad används molekylära metoder för att upptäcka och identifiera svampar. Vår institution har gått i spetsen för att utveckla dessa metoder och den nyaste tekniken, 454-pyrosekvensering, erbjuder ett nytt sätt att genomföra omfattande provtagning av svampsamhällen samt upptäcka arter som finns i små mängder och de som inte producerar fruktkropppar.
Vilka är vi:
Jan Stenlid (Professor)
Rimvydas Vasaitis (Forskare)
Elna Stenström (Forskare)
Pia Barklund (Forskare)
Katarina Irhmark (Forskare)
Ariana Kubartova (Post doktor)
Cécile Monard (Post doktor)
Johanna Boberg (Post doktor)
Anna Hopkins (Post doktor)
Elisabet Eriksson (Doktorand)
Hanna Millberg (Doktorand)
Ylva Persson (Doktorand)
Våra projekt
Mikrobiell mångfald och kitinnedbrytning längs ett markbundet-akvatiska kontinuum
Kontakt: Cécile Monard och Jan Stenlid
Svampdiversitet och aktivitet i död ved
Kontakt: Ariana Kubartova och Jan Stenlid
Succession av trä-levande svampsamhällen i förmultnande granstockar
Kontakt: Elisabet Eriksson och Anders Dahlberg
Detektion av svampsamhällen i tallbarr
Kontakt: Hanna Millberg, Johanna Boberg och Jan Stenlid
Svampar associerade med barkborrar
Kontakt: Ylva Persson , Rimvydas Vasaitis och Jan Stenlid
Artspecifik detektering av skogpatogener
Kontakt: Elna Stenström & Katarina Irhmark
Molekylär detektion och prognostisering av sjukdom
Kontakt: Rimvydas Vasaitis