Enligt EU:s Fiskevattendirektiv (78/659/EEG) skall vattenkvaliteten övervakas i ett antal utvalda sjöar och vattendrag med syftet att upprätthålla livskraftiga fiskbestånd. Riktvärden eller miljökvalitetsnormer för vattenkvaliteten i dessa områden anges i förordningen om Miljökvalitetsnormer för fisk- och musselvatten (SFS 2006:1140). De områden som skall övervakas är förtecknade i Naturvårdsverkets författningssamling NFS 2002:6.
Länsstyrelserna har ansvaret för övervakningen som omfattar följande parametrar:
| Obligatoriska |
Vägledande |
| vattentemperatur |
totalfosfor |
| löst syre |
nitriter |
| pH |
koppar |
| ammonium |
uppslammade fasta substanser |
| ammoniak |
BOD5 (biokemisk syrgasförbrukning) |
| fenolföreningar |
|
| restklor |
|
| mineraloljebaserade kolväten |
|
| zink |
|
Av dessa undersöks framförallt temperatur, syrgas, pH och ammonium i merparten av de svenska vattnen, medan nitrit, koppar, zink och restklor endast undersöks i begränsad omfattning. Övriga parametrar ingår inte i den svenska övervakningen enligt fiskevattendirektivet, då de i en förstudie befanns förekomma i så låga halter att de inte anses orsaka några problem. Övervakningen skall genomföras på ett enhetligt sätt enligt Naturvårdsverkets föreskrift över Mätmetoder och redovisning av mätresultat m.m. avseende fiskevatten (NFS 2005:11)
Resultat 2005-2008
Överlag är vattenkvaliteten i de övervakade fiskevattnen god, men det finns några problemområden med framförallt periodvis låga syrgashalter och i samband med detta ibland även höga ammoniumhalter i vattnet (se kartan till höger).
Dessa problemområden är främst de näringsrika åarna i Sydväst-Sverige, samt i de djupare delarna av en del näringsrika sjöar i den sydliga och mellersta delen av landet. I viss mån omfattas även en del av vattendragen i den nordliga delen av landet, men vanligtvis i lägre frekvenser än i den södra delen.
Normalt handlar det om att miljökvalitetsnormerna för löst syre underskrids och/eller att riktvärdena för ammonium överskrids. I några enstaka fall passeras även de kritiska syrgasnivåer som förordningen anger skall föranleda att den ansvariga Länsstyrelsen ”förvissar sig om att detta inte inverkar skadligt på en balanserad utveckling av fiskpopulationen”.