Bakteriers antagonism mot växtpatogener i ett genomperspektiv

Endofutiska bakterier isolerade från raps och smultron med växtstimulerande och antagonistiska effekter på patogena svampar. Dessa effekter studeras närmare genom genomsekvensering och transkriptomstudier i samarbete med Joint Genome Institute, Department of Energy, USA. Vi använder oss utav RNA amplifiering från interaktioner mellan bakterier och svamppatogener. Transkriptomet kommer sedan att studeras i relation till genomet.

Personal: Nils Högberg, Sadhna Alström, Roger Finlay och Saraswoti Neupane 

Externa samarbetspartners: Joint Genome Institute.

Kontaktinformation: nils.hogberg@mykopat.slu.se, sadhna.alstrom@mykopat.slu.se, roger.finlay@mykopat.slu.se