Markörer för upptäckt av anthelmintikaresitens - från gårdsnivå till gennivå

Parasitiska nematoder orsakar globalt allvarliga sjukdomsproblem hos både växter och djur. När infektioner inte längre går att kontrollera leder det till försämrad hälsa, välfärd och produktion. Djur behandlas därför ofta med anthelmintika.

Särskilt när det gäller parasiter hos betande djur har felaktig avmaskning drivit på resistensutvecklingen, men i allt högre grad även hos andra djurarter och hos människor. I projektet ska vi använda epidemiologiska och genetiska verktyg för att ta reda på vad som orsakar resistens mot anthelmintika hos den blodsugande stora rundmasken Haemonchus contortus, som parasiterar får.

Först kommer vi att använda GWAS (helgenomsekvensering kombinerat med bioinformatikanalys) för att identifiera genvarianter hos vuxna maskar som är associerade med resistens. Närvaron av påvisade genvarianter i poolade parasitprover från minst 40 slumpmässigt utvalda gårdar kommer sedan att undersökas vidare genom att generera SNP-matriser.

På gårdarna kommer vi också att mäta minskningen av äggläggning av parasiten efter avmaskning. Data om djurflöden och avmaskningsrutiner samlas också att in. Detta kommer att göra det möjligt för oss att beräkna riskfaktorer relaterade till gårdarnas resistensstatus. Slutligen utvecklas nya genetiska tester baserade på digital PCR-teknik. Detta kommer att möjliggöra ännu mer omfattande forskning, som kopplar samman de genetiska resultaten med behandlingseffekten mätt på traditionellt sätt.

Projektets långsiktiga mål är att ta fram molekylära diagnostiska verktyg för att upptäckt av resistens som kan användas rutinmässigt. Genom att övervaka situationen kan vi bättre förstå hur resistens utvecklas och hur ytterligare spridning kan motverkas.