Postdoktor: Lokala anpassningars genomik i jordbrukslandskap

Institutionen för ekologi

Vi söker en postdoktor till ett projekt som fokuserar på genomiska avtryck hos stenskvättor (Oenanthe oenanthe) av förändrat jordbruk och klimat. Du kommer att ingå i ett starkt internationellt forskarteam med kompetens som sträcker sig från evolutionär ekologi, genomik, populationsdynamik till statistisk modellering.

Om jobbet
Jordbruket i Europa har stått under avsevärd förändring sedan slutet av 1600-talet och speciellt så de senaste 75 åren. Samtidigt har många fågelpopulationer genomgått dramatiska minskningar i populationsstorlek samtidigt som de utsatts för nya urvalsmönster. Tidsmässigt har jordbruket förändrats olika i olika delar av Europa. Likaså har klimatförändringen varit olika på låglandet jämfört med bergsregionerna. Denna rumsliga och tidsmässiga variation gör det möjligt att undersöka om miljöförändringar ger liknande eller olika fotavtryck i genomet på grund av nya urvalstryck.

Stenskvättan häckar i låglandets jordbruksområden samt i höglandets bergslandskap i Europa. Medan jordbrukspopulationerna har minskat markant under de senaste 50 åren verkar bergspopulationerna vara mer stabila. För att undersöka de genomiska fotavtrycken av miljöförändringar hos nordliga stenskvättor samlar vi in klimat-, markanvändnings- och helgenomsdata från flera populationer över hela Europa. Dessutom tar vi fram ett referensgenom samt helgenomsekvensdata (WGS) från 1400 häckande individer som vi kopplar till högkvalitativa demografiska data från 3000 häckningsförsök från en 30-årig populationsstudie av stenskvättor i odlingslandskapet utanför Uppsala för att söka genetiska kopplingar till adaptiva eller maladaptiva egenskaper (t.ex. dåligt habitatval och tidpunkt för häckning).

Postdoktorn kommer att bidra till detta projekt som syftar till att undersöka hur naturliga populationer som lever i jordbrukslandskap evolutionärt hanterar snabba klimat- och markanvändningsförändringar. Centrala frågor inkluderar: (i) kan vi spåra populationers evolutionära historik och dess relation till miljömässiga förändringar i jordbruk respektive klimat, (ii) vilka adaptiva eller maladaptiva egenskaper och gener är inblandade i denna evolutionära förändring och (iii) hur snabbt förändras dessa egenskaper? Projektet är ett nära samarbete mellan forskare vid SLU (TP, Jonas Knape), Uppsala universitet, EBC (Anna Qvarnström) och Schweiziska Ornitologiska Institutet (Reto Burri) och täcker den kompetens som krävs för projektet. Nära koppling till Scilife-lab, Nationell bioinformatisk infrastruktur (NBIS) och infrastruktur för superdatorer (NAISS) garanterar en robust plattform för allt genomiskt arbete.

Din bakgrund 

Vi söker en person med dokumenterad forskningserfarenhet och intresse för genomik, bioinformatik och evolutionär ekologi. Du kommer att använda populationsgenomiska metoder för att spåra och beskriva evolutionära historier i populationer som utsatts för lika eller olika miljöförändringar under de senaste 100 åren och du kommer koppla genfunktioner till fenotypiska egenskaper under evolutionär förändring. Genomiska associationsstudier (GWAS) och annoterade referensgenomdata kommer också att användas i sökandet efter den genetiska-fenotypiska arkitekturen för adaptivt/icke-adaptivt habitatval och tidpunkt för häckning i vår långtidsstudie av stenskvättor. Dessutom kommer du att samarbeta i våra analyser om 30-årig dynamik i ofördelaktigt habitatval och feltajmad tidpunkt för häckning.

Kvalifikationer:

- Doktorsexamen i populationsgenetik, bioinformatik, ekologi och evolution eller liknande ämnesområde

- God forskningserfarenhet dokumenterad genom publikationer

- Dokumenterad erfarenhet av relevant bioinformatik och genomik

- Erfarenhet av genom-ihopsättning (assembly) och annotering

- Skriftlig och muntlig kommunikationsförmåga på akademisk nivå på engelska

- God tidshanterings- och organisationsförmåga

- Förmåga att arbeta effektivt både i en självständig roll och i samarbete med andra  

- Expertis inom evolutionär populationsekologi och/eller genetik är meriterande

Om oss

Tjänsten är placerad vid institutionen för ekologi, som är en del av Ekologiskt centrum vid Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) i Uppsala. Postdoktorn kommer dessutom ofta att besöka forskare vid avdelningen för Zooekologi, EBC vid Uppsala universitet - en dynamisk internationell och tvärvetenskaplig forskningsmiljö med fokus på evolution och ekologi av anpassningar under snabba miljöförändringar. Vid Ekologicentrum, SLU, bedriver vi forskning för hållbart jordbruk, skogsbruk och bevarande av biologisk mångfald för att mildra effekterna av markanvändning och klimatförändringar på biologisk mångfald och ekosystemtjänster. Baserat på omfattande nationella och internationella forskningssamarbeten bygger vi forskning och kommunikation som främjar ekologi som vetenskap och hållbar mänsklig markanvändning.

Mer information om institutionen/avdelningen: Institutionen för ekologi | slu.se

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba vid SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Placering:

Uppsala.

Anställningsform:

Tidsbegränsad anställning 24 månader, med ev. möjlighet till förlängning.

Omfattning:

100%.

Tillträde:

September 2026, eller enligt överenskommelse.

Ansökan:

Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast 2026-06-05.

Urvalet bland sökande sker baserat på skriftlig ansökan och intervjuer. Ansökan ska vara skriven på engelska och innehålla:

1) en beskrivning av akademiska intressen och varför sökanden är intresserad av just denna tjänst, med en specifikation av sökandens expertis inom forskningsområdet (max 5000 tecken inklusive mellanslag)

2) Curriculum Vitae inklusive en komplett publikationslista uppdelad i referentgranskade och icke-referentgranskade publikationer

3) kontaktuppgifter till två professionella referenser

4) kopior av examensbevis och betyg från grund- och forskarutbildning på universitetsnivå

Fackliga kontaktpersoner:

https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/

Vänligen skicka in din ansökan senast den 5 juni 2026. Du kan skicka in din ansökan genom att klicka på knappen nedan.

Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) har en nyckelroll i utvecklingen för hållbart liv, grundad i vetenskap och utbildning. Genom vårt fokus på samspelen mellan människa, djur och ekosystem och ett ansvarsfullt brukande av naturresurserna bidrar vi till en hållbar samhällsutveckling och goda livsvillkor på vår planet. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet. SLU har drygt 4000 medarbetare, 6000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över 4,5 miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden. Vi arbetar för en jämställd och inkluderande arbetsmiljö där öppna samtal mellan människor med olika erfarenheter lägger grunden för vetenskaplighet, kreativitet och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och perspektiv att söka den aktuella anställningen.