Markens biologi och biogeokemiska kretslopp

Dear all course participants!

On Monday 17th January the course begins with an introductory lecture at 10.15-12. Due to the (still) ongoing Pandemic we have changed all lectures and seminars during the first course week to on-line zoom activities, and depending on the situation we may continue to do so.

Please find the relevant Zoom link below!

The Laboratory Practicals will be on campus, but adapted for maximum safety. The first in-person Practical will be on Wednesday 19/1 at 9.15-12 in the Böl Labs 1+2 at the entrance level in the BioCenter.

We have also postponed the excursion planned for 21/1, but hope to have it in a few weeks instead.

The course schedule has been updated in the PDF.

Looking forward to see you all on zoom at 10.15 on Monday then!

Karina

Topic: SBBC2022 Intro lecture

https://slu-se.zoom.us/j/69629745380

Meeting ID: 696 2974 5380

Passcode: SBBC2022

Kursvärderingen är avslutad

BI1322-30159 - Sammanställning av kursvärdering

Efter att kursvärderingen stängt har kursansvarig och studentrepresentanten upp till en månad på sig att skriva kommentarer. De publiceras automatiskt i sammanställningen.

Andra kursvärderingar för BI1322

Läsåret 2021/2022

Markens biologi och biogeokemiska kretslopp (BI1322-M3159)

2022-01-17 - 2022-03-23

Läsåret 2020/2021

Markens biologi och biogeokemiska kretslopp (BI1322-30243)

2021-01-18 - 2021-03-23

Läsåret 2019/2020

Markens biologi och biogeokemiska kretslopp (BI1322-30124)

2020-01-20 - 2020-03-24

Läsåret 2018/2019

Markens biologi och biogeokemiska kretslopp (BI1322-30106)

2019-01-21 - 2019-03-25

BI1322 Markens biologi och biogeokemiska kretslopp, 15,0 Hp

Soil biology and biogeochemical cycles

Ämnen

Biologi Markvetenskap

Utbildningens nivå

Avancerad nivå

Moduler

Benämning	Hp	Kod
Föreläsningar, litteratur och seminarier	7,5	0102
Laboratorieövningar	3,0	0103
Projektarbete	4,5	0104

Fördjupning

Avancerad nivå, har endast kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav(A1N)

Betygsskala

Språk

Engelska

Förkunskapskrav

Kunskaper motsvarande:

• 150 hp på grundnivå, varav

• 60 hp i ett naturvetenskapligt ämne såsom biologi, lantbruksvetenskap, markvetenskap, geovetenskap, miljövetenskap eller teknik/teknologi,

• 15 hp kemi,

• 15 hp markvetenskap, geovetenskap eller biologi

samt

• Engelska 6.

Mål

Kursen syftar till att ge en djupare förståelse av markens biologi och biogeokemiska kretslopp, som grund för diskussioner kring markorganismernas roll i ekosystem och produktionssystem, samt deras delaktighet i globala miljöförändringar.



Efter avslutad kurs ska studenten kunna:

• beskriva viktiga markorganismgrupper, hur de interagerar med varandra och hur de förhåller sig till miljöfaktorer,

• beskriva biogeokemiska processer och hur organismer driver dessa över olika skalor,

• tillämpa kvalitativa och kvantitativa metoder för att analysera markorganismer, biogeokemi och viktiga kretslopp,

• analysera, utvärdera och kommunicera markbiologiska och biogeokemiska data,

• diskutera människans påverkan och återkopplingar mellan marken och de biogeokemiska kretsloppen, med särskilt fokus på markanvändning och globala miljöförändringar.

Innehåll

Följande ämnen kommer att behandlas i kurslitteratur, föreläsningar, uppgifter, litteraturdiskussioner, exkursioner, laborationer och projektarbeten:

• globala biogeokemiska kretslopp: kol, kväve, svavel och fosfor och bakomliggande processer,

• metoder för att studera biogeokemiska kretslopp: isotoper, organiskt material och ämnesflöden,

• markorganismer och deras roll i processer: metabolism, nedbrytning, näringsomsättning, vittring och markstruktur,

• ekologi: teori, strategier, samhällsdynamik, interaktioner och trofiska nivåer,

• kolets kretslopp: organiskt material – omsättning och stabilitet,

• kvävets kretslopp: omvandlingar och markbördighet,

• grundläggande markbiologiska och biogeokemiska laboratorietekniker,

• människans påverkan: skogs– och jordbruk, uthållig intensifiering, ekologiskt jordbruk, ekotoxikologi, globala miljöförändringar, ekosystemtjänster och biologisk mångfald,

• den vetenskapliga processen: experimentdesign, dataanalys, kritisk granskning och presentation.

Examinationsformer och fordringar för godkänd kurs

Alla kursmoment utom föreläsningar är obligatoriska. För godkänd kurs krävs följande:

• godkänd skriftlig sluttentamen som behandlar det teoretiska kursinnehållet från föreläsningar och litteratur,

• godkänt deltagande i laborationsövningar, litteraturdiskussioner och exkursioner,

• godkänd muntlig och skriftlig redovisning av projektarbete.

• Om studenten inte blivit godkänd på ett prov har examinatorn rätt att ge en kompletteringsuppgift – om det finns skäl för det och om det är möjligt.
• Om studenten har ett beslut från SLU om särskilt pedagogiskt stöd på grund av funktionsnedsättning, har examinatorn rätt att ge ett anpassat prov eller låta studenten genomföra provet på ett alternativt sätt.
• Om denna kursplan ändras, eller om kursen läggs ner, ska SLU besluta om övergångsregler för examination av studenter som antagits enligt denna kursplan och ännu inte blivit godkända.
• För examination av självständigt arbete (examensarbete) gäller dessutom att examinatorn kan tillåta studenten att göra kompletteringar efter inlämningsdatum. Mer information finns i utbildningens regelsamling.

Övriga upplysningar

• Rätten att delta i undervisning och/eller handledning gäller endast det kurstillfälle som studenten blivit antagen till och registrerad på.
• Om det finns särskilda skäl, har studenten rätt att delta i moment som kräver obligatorisk närvaro vid ett senare kurstillfälle. Mer information finns i utbildningens regelsamling.

Ansvarig institution/motsvarande

Institutionen för Mark och miljö

Medansvariga:

Kompletterande uppgifter

Learning outcome 1

3: Describe major groups of soil organisms, their interactions and responses to environmental conditions

4: Explain how particular changes in environmental conditions may affect soil organisms and their interactions

5: Demonstrate capacity to critically challenge the course content, to compare contrasting views and to actively integrate course content with earlier personal experience

Learning outcome 2

3: Describe biogeochemical processes and their interplay with organisms across scales

4: Explain how particular changes in organism activities may affect biogeochemical processes across scales

5: Demonstrate capacity to critically challenge the course content, to compare contrasting views and to actively integrate course content with earlier personal experience

Learning outcome 3

3: Apply different methods for qualitative and quantitative analyses of soil organisms, biochemistry and major elemental cycles

4: Compare and discuss outcomes of different qualitative and quantitative analyses of soil organisms, biochemistry and major elemental cycles and how they relate to each other

Learning outcome 4

3: Analyze, evaluate and communicate soil biological and biogeochemical data

4: Demonstrate the ability to communicate and summarize various soil biological and biogeochemical data in a coherent manner.

Learning outcome 5

3: Discuss impacts of human practices and potential feedbacks between soils and biogeochemical cycles, with emphasis on land use and global change

4: Synthesize relevant hypotheses based on current societal/environmental issues concerning soil biology and biogeochemical cycles

5: Argue which new approaches could be used to solve societal/environmental issues concerning soil biology and biogeochemical cycles, and identify current knowledge gaps

--------------------------------------------------------------

Teaching activities related to each intended learning outcome

• 7.5 ECTS - Approved written final examination of theoretical course content based on lectures and literature (ILO 1,2,5)
• 3.0 ECTS - Approved participation in laboratory exercises, literature discussions, and excursions (ILO 3, 4)
• 4.5 ECTS - Approved participation in project work including oral and written presentation (ILO 4, 5)

Participation is obligatory for all course elements indicated with a * in the schedule

1. Chapter 9 - The Metabolic Physiology of Soil Microorganisms Författare: Alain F. Plante, Maddie M. Stone and William B. McGill ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 9 - The Metabolic Physiology of Soil Microorganisms] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Biology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
   
2. Chapter 10 - The Ecology of the Soil Biota and their Function Författare: Sherri J. Morris and Christopher B. Blackwood ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 10 - The Ecology of the Soil Biota and their Function] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
   
3. Chapter 11 - Plant-Soil Biota Interactions Författare: R. Balestrini, E. Lumini, R. Borriello and V. Bianciotto ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 11 - Plant-Soil Biota Interactions] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
   
4. Chapter 12 - Carbon Cycling: The Dynamics and Formation of Organic Matter Författare: William Horwath ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 12 - Carbon Cycling: The Dynamics and Formation of Organic Matter] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
   
5. Chapter 13 - Methods for Studying Soil Organic Matter: Nature, Dynamics, Spatial Accessibility, and Interactions with Minerals Författare: Claire Chenu, Cornelia Rumpel and Johannes Lehmann ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 13 - Methods for Studying Soil Organic Matter: Nature, Dynamics, Spatial Accessibility, and Interactions with Minerals] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
   
6. Chapter 14 - Nitrogen Transformations Författare: G.P. Robertson and P.M. Groffman ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 14 - Nitrogen Transformations] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
   
7. Chapter 15 - Biological N Inputs Författare: Peter J. Bottomley and David D. Myrold ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 15 - Biological N Inputs] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
   
8. Chapter 12 - The Global Cycles of Nitrogen and Phosphorus Författare: William H. Schlesinger and Emily S. Bernhardt ISBN: 978-0-12-385874-0 [Chapter 12 - The Global Cycles of Nitrogen and Phosphorus] (https://www.sciencedirect.com/book/9780123858740/biogeochemistry) Kommentar: In: Biogeochemistry, 3rd Edition
   
9. Chapter 13 - The Global Cycles of Sulfur and Mercury Författare: W.H. Schlesinger and Emily S. Bernhardt ISBN: 978-0-12-385874-0 [Chapter 13 - The Global Cycles of Sulfur and Mercury] (https://www.sciencedirect.com/book/9780123858740/biogeochemistry) Kommentar: In: Biogeochemistry, 3rd Edition
   
10. Chapter 2 - The Soil Habitat Författare: R.P. Voroney and R.J. Heck ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 2 - The Soil Habitat] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
    
11. Chapter 11 - The Global Carbon Cycle Författare: William H. Schlesinger and Emily S. Bernhardt ISBN: 978-0-12-385874-0 [Chapter 11 - The Global Carbon Cycle] (https://www.sciencedirect.com/book/9780123858740/biogeochemistry) Kommentar: In: Biogeochemistry, 3rd Edition
    
12. Chapter 2 - Biotic Interactions in Soil as Drivers of Ecosystem Properties Författare: Richard Bardgett and David Wardle ISBN: 978-0-19-954688-6 Kommentar: In: ‘Aboveground-Belowground Linkages: Biotic Interactions, Ecosystem Processes, and Global Change.

Copies will be provided during course Oxford Series in Ecology and Evolution.

Available via Canvas-website

1. Chapter 3 – The Bacteria and Archea Författare: Ken Killham and Jim I. Prosser ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 3 – The Bacteria and Archea] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
   
2. Chapter 4 – The Soil Fungi: Occurrence Phylogeny and Ecology Författare: D. Lee Taylor and Robert L. Sinsabaugh ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 4 – The Soil Fungi: Occurrence Phylogeny and Ecology] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
   
3. Chapter 5 - Soil Fauna: Occurrence, Biodiversity, and Roles in Ecosystem Function Författare: David C. Coleman and Diana H. Wall ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 5 - Soil Fauna: Occurrence, Biodiversity, and Roles in Ecosystem Function] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
   
4. Chapter 6 - Molecular Approaches to Studying the Soil Biota Författare: Janice E. Thies ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 6 - Molecular Approaches to Studying the Soil Biota] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition
   
5. Chapter 7 - Physiological and Biochemical Methods for Studying Soil Biota and Their Functions Författare: Ellen Kandeler ISBN: 978-0-12-415955-6 [Chapter 7 - Physiological and Biochemical Methods for Studying Soil Biota and Their Functions] (https://www.sciencedirect.com/book/9780124159556/soil-microbiology-ecology-and-biochemistry) Kommentar: In: Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry, 4th Edition