Mikrobiologi

Med anledning av coronavirusets fortsatta spridning så kommer kursen att ges helt på distans via mötesplattformen Zoom. Kursens samtliga praktiska moment ersätts med teoretiska uppgifter. För mer information om hur Zoom fungerar samt hur man som student får tillgång till mjukvaran, se "Digitala verktyg för studier och distansundervisning" under denna länk:
https://student.slu.se/studieservice/vid-sjukdom-och-kris/information-om-corona/studera/

Allt kursmaterial kommer att vara tillgängligt i digital form via kursens hemsida inom undervisningsplattformen Canvas. För mer information om hur Canvas fungerar, se denna länk:
https://student.slu.se/studier/utbildningssystem/canvas-larplattform/

För att kunna genomföra kursen måste alla studenter ha tillgång till licensbelagd elektronisk litteratur som SLU prenumererar på. Därför är det ytterst viktigt att de studenter som inte kan (eller vill) ta sig till campus Ultuna ser till att skaffa sig en fungerande VPN-uppkoppling till SLUs nätverk. För mer information om VPN, se denna länk: https://student.slu.se/studieservice/it-stod1/support/databaser-och-e-tidskrifter/

Kursens upprop sker måndagen den 3e maj med start kl 9:15 via Zoom. (Länk och lösenord till kursens Zoom-rum kommer att publiceras i Canvas några dagar innan kursen startar.) Det är ytterst viktigt att de studenter som inte kan närvara vid uppropet den 3e maj så snart som möjligt kontaktar kursledaren för att bekräfta att de fortfarande planerar att gå kursen. Annars är det risk att studenter som inte hör av sig blir avregistrerade eftersom det har varit ovanligt högt söktryck på kursen och ett flertal reserver nu står på kö.

Kursvärderingen är avslutad

BI1337-40121 - Sammanställning av kursvärdering

Efter att kursvärderingen stängt har kursansvarig och studentrepresentanten upp till en månad på sig att skriva kommentarer. De publiceras automatiskt i sammanställningen.

Andra kursvärderingar för BI1337

Läsåret 2021/2022

Mikrobiologi (BI1337-40090)

2022-05-02 - 2022-06-05

Läsåret 2019/2020

Mikrobiologi (BI1337-40032)

2020-05-01 - 2020-06-07

BI1337 Mikrobiologi, 7,5 Hp

Microbiology

Ämnen

Biologi

Utbildningens nivå

Grundnivå

Moduler

Benämning	Hp	Kod
Mikroorganismernas biologi	3,0	0202
Samspelet mellan mikroorganismerna och människan	2,0	0203
Laborationer	2,5	0204

Fördjupning

Grundnivå, har mindre än 60 hp kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav(G1F)

Betygsskala

Språk

Svenska

Förkunskapskrav

Kunskaper motsvarande 7,5 hp biokemi eller 7,5 hp cellbiologi.

Mål

Kursen skall ge en förståelse för hur mikroorganismer, främst bakterier och svampar, är uppbyggda, förökar sig samt samspelar med den omgivande miljön. Kursens syfte är att ge grundläggande kunskaper och laborativ träning i mikrobiologi.



Efter genomgången kurs skall studenterna kunna:

- beskriva den prokaryota cellens struktur och funktion

- redogöra för svampars speciella cellstruktur, samt genetik och fysiologi

- redogöra för hur en mikroorganism isoleras och karakteriseras för identifiering

- översiktligt kunna redogöra för klassificering av bakterier och svampar

- redogöra för den mikrobiella bakgrunden till samhällsproblemen runt användandet av antibiotika

- använda och översiktligt redogöra för grundläggande mikrobiologiska laboratorietekniker

Innehåll

Huvuddelen av kursen utgörs av mikrobiologi med tyngdpunkt på bakterier och svampar men även protozoer och alger behandlas. Kursen ger också grundläggande kunskaper i olika mikroorganismers metabolism. En viktig del av kursen utgörs av laborativa övningar.



Vid föreläsningar och obligatoriska laborationer behandlas följande avsnitt:

- metoder för att isolera och studera mikroorganismer

- bakteriers cellstruktur, fysiologi, energimetabolism, basal genetik och tillväxt

- svampars cellstruktur, fysiologi, genetik, metabolism och tillväxt

- bakterier och svampars systematik och taxonomi

- översikt av egenskaper och funktioner hos alger och protozoer

- metoder för avdödning och desinfektion av mikroorganismer

- antimikrobiella substanser och resistensutveckling

Examinationsformer och fordringar för godkänd kurs

Godkända skriftliga deltentamina, godkänt deltagande i laborationer med muntliga och skriftliga redovisningar. Godkänd närvaro vid obligatoriska kursmoment.

• Om studenten inte blivit godkänd på ett prov har examinatorn rätt att ge en kompletteringsuppgift – om det finns skäl för det och om det är möjligt.
• Om studenten har ett beslut från SLU om särskilt pedagogiskt stöd på grund av funktionsnedsättning, har examinatorn rätt att ge ett anpassat prov eller låta studenten genomföra provet på ett alternativt sätt.
• Om denna kursplan ändras, eller om kursen läggs ner, ska SLU besluta om övergångsregler för examination av studenter som antagits enligt denna kursplan och ännu inte blivit godkända.
• För examination av självständigt arbete (examensarbete) gäller dessutom att examinatorn kan tillåta studenten att göra kompletteringar efter inlämningsdatum. Mer information finns i utbildningens regelsamling.

Övriga upplysningar

• Rätten att delta i undervisning och/eller handledning gäller endast det kurstillfälle som studenten blivit antagen till och registrerad på.
• Om det finns särskilda skäl, har studenten rätt att delta i moment som kräver obligatorisk närvaro vid ett senare kurstillfälle. Mer information finns i utbildningens regelsamling.

Ytterligare information

Kurserna Mikrobiologi 7,5 hp och Mikrobiologi och immunförsvar 10 hp kan på grund av överlappningar inte tillsammans ingå i examen.

Ansvarig institution/motsvarande

Institutionen för molekylära vetenskaper

Kompletterande uppgifter

Betygskriterier för kursen BI1337 Mikrobiologi (7,5 hp), VT2021

Betygskriterierna har fastställts av examinator Tomas Linder.

Kurs BI1337 består av två teoretiska moduler (“Mikroorganismernas biologi”, 3 hp, och “Samspelet mellan mikroorganismer och människan”, 2 hp) samt en laborativ modul (2,5 hp). De teoretiska modulerna kommer att examineras i form av skriftliga tentamina med följande betygsättning:

• För betyg 3 krävs att man uppnått ca 55 % av möjliga poäng.
• För betyg 4 krävs att man uppnått ca 70 % av möjliga poäng.
• För betyg 5 krävs att man uppnått ca 85 % av möjliga poäng.

Slutbetygen för modul I och II reflekterar således detaljnivån på studentens kunskap inom ämnet mikrobiologi enligt betygskriterierna i tabellen nedan.

	Modul I (3 hp)	Modul II (2 hp)
Betyg	“Mikroorganismernas biologi”	“Samspelet mellan mikroorganismer och människan”
5	Studenten kan redogöra i detalj för mikroorganismernas biologi med avseende på cellulär struktur, fysiologi, metabolism, genetik, systematik och ekologi.	Studenten kan redogöra i detalj för mikroorganismernas samspel med människan med avseende på patogena mikroorganismer, antimikrobiella terapier och andra kontrollmetoder, mikroorganismernas roll inom livsmedelsproduktion och bioteknologiska tillämpningar av mikroorganismer.
4	Studenten kan redogöra för grunderna inom mikroorganismernas biologi med fördjupning inom några av områdena cellulär struktur, fysiologi, metabolism, genetik, systematik och ekologi.	Studenten kan redogöra för grunderna inom mikroorganismernas samspel med människan med fördjupning inom några av områdena patogena mikroorganismer, antimikrobiella terapier och andra kontrollmetoder, mikroorganismernas roll inom livsmedelsproduktion och bioteknologiska tillämpningar av mikroorganismer.
3	Studenten kan redogöra för grunderna inom mikroorganismernas biologi med avseende på cellulär struktur, fysiologi, metabolism, genetik, systematik och ekologi.	Studenten kan redogöra för grunderna inom mikroorganismernas samspel med människan med avseende på patogena mikroorganismer, antimikrobiella terapier och andra kontrollmetoder, mikroorganismernas roll inom livsmedelsproduktion och bioteknologiska tillämpningar av mikroorganismer.

Den laborativa modulen (2,5 hp) kommer att examineras i form av två kortare skriftliga inlämningsuppgifter (betygskala U/G) samt en något mer detaljerad labbrapport (betygskala U/3/4/5). Labbrapporten utgör 100 % av betyget för den laborativa modulen och kommer att bedömas enligt följande kriterier:

1. Ämneskunskap (betygskala U/3/4/5). Här bedöms den kunskap studenten uppvisar i ämnet mikrobiologi. För betyg över 3 krävs det att studenten demonstrerar kunskap utöver vad som tagits upp inom laborationens skriftliga instruktioner samt under kursens föreläsningar.

2. Analytisk förmåga och kritiskt tänkande (betygskala U/3/4/5). Här bedöms studentens förmåga att tolka era egna resultat, dra slutsatser samt tillämpa dessa slutsatser för att formulera nya frågor och hypoteser.

3. Stil och struktur (betygskala U/3/4/5). Här bedöms studentens förmåga uttrycka sig på ett strukturerat och korrekt akademiskt sätt. Detta innebär t.ex. att använda en formell och opersonlig ton, tydlig och logisk argumentation, rätt användning av tempusformerna preteritum (dåtid) och presens (nutid), undvikande av vaga påståenden, undvikande av talspråk, undvikande av upprepningar eller annan onödig text samt att rätt text finns på rätt plats i rapporten.

4. Användning av källmaterial (betygskala U/3/4/5). Här bedöms studentens förmåga att både använda och referera till lämpliga och relevanta källor. För betyg över 3 krävs det att studenter använder relevanta och lämpliga referenser utöver de som anges i laborationens skriftliga beskrivning, att merparten av faktuella påståenden i studentens text är underbyggda med lämpliga och relevanta citat samt att referenslistan följer ett konsekvent format.

5. Språk och presentation (betygskala U/G). Här bedöms studentens förmåga att kommunicera tydligt i skrift och med hjälp av figurer.

Samtliga kriterier måste vara godkända för att rapporten som helhet ska vara godkänd. Slutbetyget för rapporten motsvarar det aritmetiska medelvärdet för de fyra första kriterierna med avrundning. För sammanvägt betyg 4 krävs alltså åtminstone två 4or och två 3or alternativt en 5a och tre 3or. För sammanvägt betyg 5 krävs åtminstone två 5or och två 4or.

Slutbetyget för hela kursen motsvarar det viktade aritmetiska medelvärdet för modulernas individuella betyg.

1. Brock Biology of Microorganisms – Global Edition (15e upplagan) Författare: Michael T Madigan, Kelly S Bender, Daniel H Buckley, W. Matthew Sattley, David A. Stahl ISBN: 9781292235103 Kommentar: Detta är den rekommenderade kursboken för denna kurs.
   
2. Microbiology Författare: Nina Parker, Mark Schneegurt, Anh-Hue Thi Tu, Philip Lister, Brian M. Forster ISBN: 9781947172234 [Microbiology] (https://openstax.org/details/books/microbiology) Kommentar: Denna bok är ett möjligt alternativ till "Brock Biology of Microorganisms". Boken är helt gratis att läsa och ladda ner i pdf-format och har tagits fram av den ideella föreningen OpenStax vid Rice University i USA i samarbete med American Society for Microbiology. Boken håller hög kvalité men är dock inte lika heltäckande som “Brock Biology of Microorganisms".
   
3. Principles of Molecular Virology (6e upplagan) Författare: Alan J. Cann ISBN: 9780128019467 [Principles of Molecular Virology (6e upplagan)] (https://www.sciencedirect.com/book/9780128019467/principles-of-molecular-virology) Kommentar: Studenter kommer att hänvisas till utvalda kapitel i denna bok, som är tillgänglig utan kostnad i digital form inom SLUs nätverk eller via VPN-uppkoppling som SLU student.
   
4. Processes in Microbial Ecology Författare: David L. Kirchman ISBN: 9780198789406 [Processes in Microbial Ecology] (https://oxford.universitypressscholarship.com/view/10.1093/oso/9780198789406.001.0001/oso-9780198789406) Kommentar: Studenter kommer att hänvisas till utvalda kapitel i denna bok, som är tillgänglig utan kostnad i digital form inom SLUs nätverk eller via VPN-uppkoppling som SLU student.
   
5. Environmental Microbiology (3e upplagan) Författare: Ian L. Pepper, Charles P. Gerba, Terry J. Gentry ISBN: 9780123946263 [Environmental Microbiology (3e upplagan)] (https://www.sciencedirect.com/book/9780123946263/environmental-microbiology) Kommentar: Studenter kommer att hänvisas till utvalda kapitel i denna bok, som är tillgänglig utan kostnad i digital form inom SLUs nätverk eller via VPN-uppkoppling som SLU student.
   
6. The Fungi (3e upplagan) Författare: Sarah C. Watkinson, Lynne Boddy, Nicholas P. Money ISBN: 9780123820341 [The Fungi (3e upplagan)] (https://www.sciencedirect.com/book/9780123820341/the-fungi) Kommentar: Studenter kommer att hänvisas till utvalda kapitel i denna bok, som är tillgänglig utan kostnad i digital form inom SLUs nätverk eller via VPN-uppkoppling som SLU student.