Laboratorieassistent till UPSC

Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi

Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi är en del av Umeå Plant Science Centre (UPSC, https://www.upsc.se) som är ett kompetenscentrum för experimentell växtforskning och skogsbioteknik i norra Sverige. UPSC vill göra excellent och innovativ grundforskning och skapa kunskap till nytta för skogsbruk, jordbruk, miljö och samhälle. Vi studerar växter från cellnivå upp till till ekofysiologi, samt från grundforskning till industriella tillämpningar. Vi försöker att förstå växters förmåga att växa, anpassa sig och acklimatisera sig till en föränderlig värld, kunskaper som kan leda till bättre växtsorter, odlingspraxis eller industriprocesser.

Om jobbet

Jämförande co-expressionsanalys av abiotisk stress.

Vi söker en person som vill arbeta med ett projekt som syftar till att identifiera bevarade regulatorer för abiotisk stressrespons hos barrträd.

Dina arbetsuppgifter kommer att innefatta analys och tolkning av RNA-Seq-data som profilerar köld- och torkstress hos gran och tall, samt jämförande co-expressionsanalys av dessa data. Arbetet kräver avancerade kunskaper inom dataanalys och visuell presentation av komplexa, storskaliga datamängder.

Din bakgrund

Du ska ha en masterexamen i molekylärbiologi, bioinformatik, växtvetenskap eller liknande. Du ska ha befintliga bioinformatiska färdigheter, inklusive erfarenhet av att utföra jämförande co-expressionsanalyser, användning av pseudoalignment för att kvantifiera RNA-Seq-data, kunskap om granens och tallens genomik samt stark kompetens i att köra bioinformatiska analysflöden inklusive Nextflow. Du ska även ha expertis i Python och R, inklusive användning av DESeq2-paketet, avancerade färdigheter i att skapa grafik med ggplot samt allmän kännedom om Bioconductor och arbete med Tidyverse. Du ska ha goda kunskaper i engelska, både i tal och i skrift.

Om oss

UPSC består av två institutioner som tillhör två universitet, Umeå universitet (https://www.umu.se/) och Sveriges lantbruksuniversitet (SLU; https://www.slu.se/). Här arbetar cirka 200 personer av mer än 40 olika nationaliteter. Hos oss finns ett 30-tal gruppledare och våra forskare har tillgång till toppmoderna analysplattformar, unika resurser för t ex trädgenomik och växtodlingsanläggningar. Vi strävar efter att skapa en arbetsmiljö som främjar samarbete och stöttar våra forskare genom hela karriären, bland annat genom utbildning och individuell karriärvägledning.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba vid SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Placering:

Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, SLU, Umeå. 

Anställningsform:

Tidsbegränsad anställning 3 månader.

Omfattning:

100%

Tillträde:

2025-11-07 eller enligt överenskommelse.

Ansökan:

Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast den 2025-11-04.

Fackliga kontaktpersoner:

https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/