Experimental approaches in plant growth analysis and phenotyping
Behörighetskrav
90 hp biologi eller
30 hp biologi + 60 hp skogsvetenskap inklusive 15 hp kemi eller
30 hp biologi + 60 hp trädgårdsvetenskap inklusive 15 hp kemi eller
30 hp biologi + 60 hp lantbruksvetenskap inklusive 15 hp kemi
samt
Engelska 6
Kursfakta
- Kursnamn
- Experimental approaches in plant growth analysis and phenotyping
- Engelsk kursnamn
- Experimental approaches in plant growth analysis and phenotyping
- Nivå
- Avancerad nivå (A1N)
- Huvudområde
- Lantbruksvetenskap, Biologi
- högskolepoäng
- 15.0 hp
- Studietakt
- 100 %
- Studieort
- Uppsala
- Undervisningsform
- Campusbaserad undervisning
- Anmälningskod
- SLU-10253
- Kurskod
- BI1339
- Kursspråk
- Engelska
- Ingår i utbildnings-program
-
Växtbiologi för hållbar produktion - masterprogramVäxtbiologi för hållbar produktion - masterprogram
- Ges som fristående kurs
- Ja
- Kursavgift
-
38060 SEK
Studieavgift, endast för medborgare utanför EU, EES, och Schweiz
BI1339, Experimental approaches in plant growth analysis and phenotyping, 15.0 Hp
Skriv ut kursplan
Kursplan
Fastställd av: PN - S, 2018-11-15
Giltig från och med : Hösttermin 2019 (2019-09-02)
Nivå
Avancerad nivå (A1N)
Huvudområde
Lantbruksvetenskap, Biologi
Betygsskala
Kraven för kursens olika betygsgrader framgår av betygskriterier, som ska finnas tillgängliga senast vid kursstart.
Kursspråk
Engelska
Behörighetskrav
90 hp biologi eller
30 hp biologi + 60 hp skogsvetenskap inklusive 15 hp kemi eller
30 hp biologi + 60 hp trädgårdsvetenskap inklusive 15 hp kemi eller
30 hp biologi + 60 hp lantbruksvetenskap inklusive 15 hp kemi
samt
Engelska 6
Mål
Syftet med kursen är att ge en fördjupande genomgång av de grundläggande metoderna för mätning och bedömning av tillväxt och fysiologi hos växter, tillämpning av en del av dessa metoder i ett praktiskt projekt, och en översikt över kvantitativa metoder för att mäta strukturella och funktionella växtegenskaper (s.k. fenotypning) i moderna fenotypningsanläggningar. Efter avslutad kurs ska studenten kunna:
- redogöra för de grundläggande metoderna för mätning och bedömning av tillväxt hos växter
- självständigt genomföra enkla metoder för tillväxtanalys hos växter
- självständigt planera, genomföra och bedöma vetenskapliga experiment med fokus på tillväxt hos växter i förhållande till den omgivande miljön (växt-miljö och växt-växt samspel)
- redogöra för de grundläggande principerna för tillväxtmodellering hos växter
- värdera olika kvantitativa metoder för att mäta strukturella och funktionella växtegenskaper i moderna fenotypningsanläggningar
Innehåll
•Föreläsningar Seminarier (obligatoriskt) Projektarbete (obligatoriskt) Övningsuppgifter (obligatoriskt) Självstudier Examination och utvärdering •Kursen behandlar de grundläggande metoderna för mätning och bedömning av tillväxt och fysiologi hos växter i förhållande till den omgivande miljön (växt-miljö och växt-växt samspel), tränar studenternas förmåga att tillämpa en del av dessa metoder i ett praktiskt projekt, förmedlar en grundläggande förståelse för tillväxtmodeller för växter, och ger en översikt över automatiserade metoder för att snabbt kunna mäta strukturella och funktionella växtegenskaper (s.k. fenotypning) i moderna fenotypningsanläggningar. Ämnesområden som behandlas är:
- Tillväxtanalys och funktionell fysiologi hos jordbruks- och skogsväxter
- Samspel växt-miljö och växt-växt
- Försöksupplägg och grundläggande statistik för analys av vetenskapliga resultat
- Tillväxtmodellering hos växter
- Moderna fenotypningsmetoder för växter, dvs. tekniska lösningar för att snabbt och automatiserat kunna kvantifiera strukturella och funktionella växtegenskaper hos ett stort antal växtindivider.
Examinationsformer
Godkända skriftliga eller muntliga prov, aktivt deltagande i obligatoriska seminarier och övningar, muntlig och skriftlig rapportering av projektarbetet. Kursen innehåller obligatoriska moment (seminarier, övningar, projektarbete)
Ansvarig institution eller motsvarande
Institutionen för växtproduktionsekologi
Kompletterande uppgifter
Ingår i utbildnings-program
- Växtbiologi för hållbar produktion - masterprogram
- Växtbiologi för hållbar produktion - masterprogram
Moduluppsättning
| Benämning | Hp | Kod |
|---|---|---|
| Projektarbete | 7.5 | 0101 |
| Skriftlig tentamen | 7.5 | 0102 |
| Används ej | 7.5 | 0103 |
Övrig information
Kursen ges i det fakultetsgemensamma mastersprogrammet i Växtbiologi för hållbar produktion. Kursen består av en teoridel (7,5 hp) och en projektdel (7,5 hp), men båda delar löper över hela kursperioden. Teoridelen består av föreläsningar och seminarier som kommer att erbjudas enbart online (via zoom), vilket gör det möjligt att läsa denna del på distans. Alla praktiska moment inom projektarbetet kommer att ske på plats på SLU Ultuna campus.
Course literature
BI1339 – Experimental approaches in plant growth analysis and phenotyping, 15 hp
Course leader: Martin Weih (martin.weih@slu.se)
The main course literature will be Lambers H, Chapin FS III, Pons TL (2008), Plant Physiological Ecology, Springer. An online version of this book is available from the SLU library at https://link.springer.com/book/10.1007%2F978-0-387-78341-3
Reference will be made to specific chapters of the main course literature by the teachers responsible for each teaching unit, through the course Canvas page.
In addition to the above course literature, other sources will be part of the course literature. In some cases, supporting (more basic) readings and additional (more advanced) readings will be listed (and clearly indicated) at the course Canvas page**. **All compulsory literature will be made available to the students enrolled through the course Canvas page.
The additional course literature includes the following titles (selection):
Araus JL, Kefauver SC (2018) Breeding to adapt agriculture to climate change: affordable phenotyping solutions. Current Opinion in Plant Biology 45, 237-247.
Chawade A, Van Ham J, Blomquist H, Bagge O, Alexandersson E, Ortiz R (2019) High-Throughput Field-Phenotyping Tools for Plant Breeding and Precision Agriculture. Agronomy 2019, 9, 258.
Connolly J, Wayne P, Bazzaz FA (2001) Interspecific Competition in Plants: How Well Do Current Methods Answer Fundamental Questions? The American Naturalist 157: 107-125.
Fiorani F, Schurr U (2013) Future Scenarios for Plant Phenotyping. Annual Review of Plant Biology 64:1, 267-291.
Fowler J, Cohen L, Jarvis P () Practical Statistics for Field Biology. Wiley.
Golzarian M, Frick R, Rajendran K, Berger B, Roy S, et al. 2011. Accurate inference of shoot biomass from high-throughput images of cereal plants. Plant Methods 7:2
Larcher W (2003) Physiological Plant Ecology, Springer, p. 111-119.
Poorter H, Niinemets Ü, Walter A, Fiorani F, Schurr U. 2010. A method to construct dose–response curves for a wide range of environmental factors and plant traits by means of a meta-analysis of phenotypic data. J. Exp. Bot. 61:2043–55
Weih M, Westerbergh A, Lundquist P-O (2017), Role of nutrient-efficient plants for improving crop yields: bridging plant ecology, physiology, and molecular biology, Hossain MA et al (Eds), Plant macronutrient use efficiency – Molecular and genomic perspectives in crop plants, Elsevier, p. 31-44.
Please note that all compulsory literature will be made available to the students enrolled through the course Canvas page.
läsår 2025/2026
Experimental approaches in plant growth analysis and phenotyping (BI1339-10253)
2025-10-28 - 2025-11-19
läsår 2024/2025
Experimental approaches in plant growth analysis and phenotyping (BI1339-10182)
2024-10-24 - 2024-11-14
läsår 2023/2024
Experimental approaches in plant growth analysis and phenotyping (BI1339-10154)
2023-10-23 - 2023-11-13
läsår 2022/2023
Experimental approaches in plant growth analysis and phenotyping (BI1339-10352)
2022-10-24 - 2022-11-14
läsår 2019/2020
Experimental approaches in plant growth analysis and phenotyping (BI1339-10125)
2019-10-24 - 2019-11-14
Kontakt
- Kursledare
- Martin Weih
- Examinator
- Martin Weih