Molekylär och mikrobiell ekologi: från teori till tillämpning
Kursbeskrivning
Kursen utforskar hur mikroorganismer formar och upprätthåller ekosystem med hjälp av moderna molekylära verktyg som DNA-sekvensering och bioinformatik. Du får lära dig hur mikrober samspelar med djur och växter, driver viktiga processer som näringsomsättning och ekosystemens resiliens, samt hur molekylära metoder kan avslöja deras dolda roller i naturen. Genom föreläsningar, laborationer, datoranalyser, projektpresentationer och studiebesök får du både teoretisk förståelse och praktisk erfarenhet av att tillämpa molekylär ekologi på verkliga utmaningar inom hållbart jordbruk, miljöövervakning och bevarande av biologisk mångfald.
Behörighetskrav
- 120 hp inom ett naturvetenskapligt område
- 60 hp biologi
- 5 hp mikrobiologi
- 5 hp ekologi
- Engelska 6
Kursfakta
BI1479, Molekylär och mikrobiell ekologi: från teori till tillämpning, 15.0 Hp
Skriv ut kursplan
Kursplan
Fastställd av: PN-O, 2025-12-12
Giltig från och med : Vårtermin 2027 (2027-01-18)
Nivå
Avancerad nivå (A1N)
Huvudområde
Biologi
Biologiområde
Ekologi
Betygsskala
Kraven för kursens olika betygsgrader framgår av betygskriterier, som ska finnas tillgängliga senast vid kursstart.
Kursspråk
Engelska
Behörighetskrav
- 120 hp inom ett naturvetenskapligt område
- 60 hp biologi
- 5 hp mikrobiologi
- 5 hp ekologi
- Engelska 6
Mål
Syftet med kursen är att ge kunskap om molekylär och mikrobiell ekologi samt om användningen av molekylära metoder för att besvara ekologiska och miljövetenskapliga frågor. Kursen ger kunskap om hur molekylära metoder kan användas för att lösa aktuella utmaningar relaterade till hållbar livsmedelsproduktion, vattenkvalitet, miljöövervakning och bevarande av biologisk mångfald. Den tränar också studenterna i vetenskapligt arbetssätt genom litteraturstudier och seminarier där vetenskapliga artiklar diskuteras med experter inom området, samt datorövningar där de analyserar data som de själva genererar under kursen.
Efter avslutad kurs ska studenten kunna
- Redogöra för och diskutera centrala begrepp inom molekylär och mikrobiell ekologi
- Beskriva och förklara interaktioner på molekylär nivå mellan mikroorganismer och deras biotiska och abiotiska miljö
- Förklara mikroorganismers roll för ekosystemens funktioner och diskutera möjliga tillämpningar inom miljöteknik och miljöövervakning
- Välja ut och argumentera för lämpliga molekylära metoder för att identifiera, kvantifiera och funktionellt karakterisera organismer och samhällen samt integrera kunskap för att föreslå och värdera tänkbara användningsområden
- Tillämpa molekylära laboratorietekniker som används inom molekylär och mikrobiell ekologi, samt kritiskt tolka och värdera resultaten från dem
- Dra slutsatser och värdera molekylära data som används inom ekologin utifrån statistiska och grafiska sammanställningar
Innehåll
Ämnesmässigt innehåll
Kursen behandlar
- Introduktion till molekylär ekologi och evolution
- Molekylära metoder inom ekologi, med tonvikt på studiedesign, laboratorieteknik, bioinformatik och biostatistik
- Molekylära metoder för att studera ekologiska frågeställningar och teorier, till exempel: kopplingar mellan biologisk mångfald och ekosystems funktioner, ekologiska nischer, motstånd och resiliens mot störningar i miljön
- Analyser av biotiska interaktioner i akvatiska och terrestra ekosystem med hjälp av molekylära metoder: mikrobers interaktioner med växter, djur och andra mikroorganismer, samt trofiska interaktioner inom näringsvävar och metabola nätverk
- Antropogena effekter på terrestra och akvatiska ekosystem, övervakade med molekylära metoder
- Tillämpningar av metoder inom molekylär och mikrobiell ekologi, till exempel inom: växtodling, miljöövervakning, analys av näringsvävar, klimatomställningen, djurhälsa och probiotika, naturvård, avfalls- och vattenrening
Genomförande
Kursen utnyttjar olika undervisningsformer för att främja studenternas lärande och diskussioner genom föreläsningar, seminarier, litteraturstudier, laborationer, studiebesök och projektarbete.
Kursen fokuserar på följande generella kompetenser: kritiskt tänkande, vetenskaplig metodik samt muntlig och skriftlig presentation.
Följande moment är obligatoriska: laborationer, seminarier, studiebesök och muntliga presentationer av projektarbetet.
Samverkan med det omgivande samhället sker genom studiebesök och inbjudna föreläsare.
Examinationsformer
- Muntlig och skriftlig presentation av projektarbete - Godkänt deltagande i obligatoriska moment - Skriftlig laborationsrapport - Skriftlig tentamen
Ansvarig institution eller motsvarande
Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi
Kompletterande uppgifter
Ingår i utbildnings-program
- Växtodlingsprogrammet
- Agronomprogrammet - mark/växt
Moduluppsättning
| Benämning | Hp | Kod |
|---|---|---|
| Skriftlig sluttentamen av teoretiskt kursinnehåll baserat på föreläsningar och litteratur | 5.0 | 0001 |
| Deltagande i laborationer och skriftlig rapport | 5.0 | 0002 |
| Deltagande i litteraturdiskussioner och studiebesök | 2.0 | 0003 |
| Deltagande i projektarbete inklusive muntlig och skriftlig presentation | 3.0 | 0004 |
Kursen ersätter
BI1438
Övrig information
Förkunskapskraven i mikrobiologi och ekologi kan tex uppnås genom kurserna Genetik, cellbiologi och mikrobiologi (BI1278), Ekologi (BI1252).