FORSKNINGSPROJEKT
Förbättrad reproduktion hos röding med nya sekvenseringstekniker
NYCKELPUNKTER- Projektet kommer att identifiera de viktigaste orsakerna som påverkar hanarnas fertilitet och bedöma i vilken grad de förklarar den låga reproduktionsförmågan hos röding som odlas i Sverige.
- Flera parametrar kommer att undersökas, till exempel ålder, provtagningstid under lekperioden och genetik.
- Slutligen kommer vi att analysera den möjliga effekten av dysfunktioner i den manliga reproduktionen på avkomman med hjälp av RNA-sekvensering.
Uppdaterad: augusti 2025
Översikt
Start:
januari 2024
Slut:
december 2027
Projektansvarig:
Khrystyna Kurta
Kontaktperson:
Khrystyna Kurta
Finansiär:
FORMAS
Medverkande
Projektgrupp:
Mer relaterad forskning
Kort om projektet
I en ökad efterfrågan på fiskprodukter på marknaden är röding en nyckelart. En utmaning är dock att vattenbruket visat sig resultera i lägre spermakvalitet hos just rödinghanar. Varför det sker är ännu osäkert, vilket det här forskningsprojektet nu tar sig an att undersöka.
Bakgrund
Vattenbruksindustrin i Sverige bevittnar för närvarande en betydande satsning på att öka utbudet av fiskprodukter på marknaden. Röding är en nyckelart i detta sammanhang: den är den näst mest odlade fisken i Sverige och har varit föremål för ett nationellt avelsprogram sedan 1980. Fertilitet är nyckeln till framgång för fiskodlingsindustrins hållbarhet och ekonomi.
Problem relaterade till fertilitet rapporterades hos avelsbeståndet av röding vid Vattenbrukscentrum Norr. Vattenbruk leder till sämre spermakvalitet hos rödinghanar, vilket minskar antalet befruktade ägg och kläckta embryon. De faktorer som påverkar spermiekvaliteten har dock ännu inte undersökts.
Syfte med projektet
Huvudmålen för det aktuella projektet beskrivs nedan:
-
Avslöja effekterna av ålder och lektid
Det finns begränsad information om hur hanars fertilitet förändras under deras reproduktiva liv eller som svar på provtagningstiden under lekperioden. Samtidigt kan infertila hanar som hålls i ett avelsbestånd orsaka allvarliga problem och till och med äggförlust vid kläckeriet. I det aktuella projektet kommer vi att avslöja vilka avelshanar som behåller hög fertilitet under hela reproduktionssäsongen och hur fertiliteten varierar under reproduktionsåldern. -
Avslöja de genomomfattande regioner som är associerade med manlig fertilitet
En av de största utmaningarna inom fiskgenomik är att förstå den genetiska grunden för reproduktiva egenskaper. Genetiska markörer, såsom SNP, och genomomfattande associationsstudier (GWAS) är praktiska och tillförlitliga verktyg för att upptäcka genomregioner som påverkar manlig fertilitet. Tillgången till helgenomsekvensdata underlättar avsevärt identifieringen av SNP med stor inverkan eller genomregioner som bidrar till fertilitet. Vi kommer att använda storskalig GWAS med en kostnadseffektiv teknik för helgenomsekvensering med låg täckning för att identifiera nya kandidatregioner i genomet som är associerade med manlig fertilitet hos fjällröding. -
Bestämma effekten av spermiernas transkriptomprofil på avkomman
Nya rön tyder på att spermier bär på en rad olika RNA-typer, med distinkta profiler som observerats mellan fertila och infertila män. Flera studier har också visat att spermiernas RNA har en avgörande roll i spermiebildning, befruktning och tidig embryonal utveckling. Vi kommer att tillämpa RNA-sekvensering av spermier och respektive avkomma för att fånga alla möjliga effekter av RNA på spermiefunktionen, manlig fertilitet och deras avkomma i tidiga utvecklingsstadier.