Kiselalger i mikroskop
Mikroskopbild av kiselelagena Eunotia sp. som bildar kedjeformade kolonier likt armband. Foto: Maria Kahlert.

Biblioteket över kiselalger är förbättrat

Nyhet publicerad:  2026-06-11

Forskare bakom ny studie presenterar tillägg till biblioteket över DNA-streckkoder för kiselalger. Den nya informationen ökar mängden taxa och förbättrar möjligheten att identifiera kiselalger, vilket kan effektivisera övervakningen av vattenkvalitet i sjöar och vattendrag.

Bottenlevande sötvattenskiselalger är en viktig organismgrupp både för ekologi och miljöövervakning. Därför står de i centrum när ny teknik gör det möjligt att förbättra övervakningen av svenska sötvatten.

Nya DNA-metoder har stor potential för övervakning av biologisk mångfald och ekologisk status, särskilt inom Vattendirektivet och den nyligen införda EU-förordningen om naturrestaurering, säger forskaren Maria Kahlert.

Men hittills har brister i biblioteket varit ett hinder, särskilt för mindre studerade livsmiljöer och ekoregioner.

Studiens fynd ger ny baskunskap

Forskarna bakom studien tog fram 312 kiselalgskulturer som analyserades med flera olika metoder. Nästan alla kunde sekvenseras, vilket resulterade i identifiering av 51 taxa inom 17 släkten.

Ett anmärkningsvärt resultat var den relativt höga andelen arter inom släktet Eunotia, som är underrepresenterat i databaser men ofta förekommer i svenska sötvatten, berättar Maria Kahlert.

Utöver molekylära och morfologiska data dokumenterades även kolonibildning och sexuella reproduktionsstadier i levande kulturer – information som sällan finns tillgänglig.

Eftersom all data från studien är öppet tillgänglig kan resultaten bidra till mer än träffsäker artbestämning. De kan också bidra till en bättre förståelse av släktskapsförhållanden och förbättrade referensdatabaser för miljöövervakning och forskning.

Forskningen har visat hur referensdatabaser med DNA-sekvenser från kända arter är avgörande för att tekniken ska fungera tillförlitligt. Den här studien finansierades genom ett anslag från Naturvårdsverket och har genom sin innebörd för miljöövervakningen i vatten, även stark koppling till Havs- och vattenmyndigheten.

Den vetenskapliga studien

Kahlert M, Mora D, Kusber W-H, Abarca N, Zimmermann J (2026). New DNA barcode reference data of freshwater diatoms (Bacillariophyceae) from Sweden: old acquaintances and new taxa. Metabarcoding and Metagenomics 10: e186778. https://doi.org/10.3897/mbmg.10.186778 

Kiselalger och DNA-tekniken

Kiselalger är mikroskopiska alger som lever i vattenmiljöer och är känsliga för förändringar i miljön. Därför används de ofta som indikatorer på vattenkvalitet.

Metabarcoding är en metod där man analyserar DNA. Det går att analysera DNA-markörer från många arter samtidigt, vilket gör det möjligt att snabbt identifiera hela organism­samhällen i ett enda prov.

Sekvensering är en metod för att läsa av ordningen av byggstenarna i DNA. Genom att bestämma denna ordning kan forskare identifiera olika organismer och förstå deras genetiska information.

Kontakt