undersidan av ett mosstäcke visar små vita svampa
Foto: Karina Clemmensen

Markbiologi

Sidan granskad:  2025-06-16

Svampar, bakterier och djur bildar komplexa samhällen i marken och interagerar med växtrötter, organiskt material och mineraler. Markorganismer spelar en viktig roll inom jordbruk och skogsbruk och är centrala för regleringen av ekosystemens kol- och näringsomsättning.

En ökad förståelse för markens biologi gör det möjligt att bättre kunna förutse hur ekosystem reagerar på miljöförändringar i samband med skogsbruk, föroreningar och klimatförändring.

På grund av utmaningarna med att studera underjordiska organismer och processer finns det fortfarande stora kunskapsluckor och mycket att upptäcka.

Forskningsteman

Klimat

Det finns stora mängder kol i marken som kan minska eller öka mängden växthusgaser i atmosfären. Den markbiologiska forskningen är viktig för att kunna förstå hur organismer och processer i marken påverkar kollagring i marken och därmed den pågående klimatförändringen. Genom forskningen kan vi bidra med bättre prognoser för hur klimatet kan utvecklas framöver och hur detta påverkar olika ekosystem.

Biologisk mångfald

Forskningen ger också kunskap om hur jord- och skogsbruk påverkar markens biologiska mångfald och markprocesser som dessa organismer driver, till exempel omsättning av näringsämnen och nedbrytning av organiskt material i marken.

Vår forskning kan besvara frågor som till exempel

  • På vilka sätt deltar olika markorganismer i uppbyggnad och nedbrytning av organiskt material i marken?
  • Hur kan växterna driva viktiga processer i marken genom att leva i symbios med andra markorganismer, t.ex. i mykorrhiza-samverkan med svampar?
  • Hur påverkar klimat- och miljöförändringar markens organismsamhällen och de processer som de driver?

Vår forskning spänner från molekylärbiologi, bioinformatik och biokemi, via mikrobiologi och samhällsekologi, till ekosystemekologi.

Forskningsmetoder

Vi är ledande inom DNA- och RNA-baserade analyser av svampsamhällen. Dessa metoder är under snabb utveckling och erbjuder tidigare oanade möjligheter att studera vilka arter som förekommer i marken och, via studier av genuttryck (s.k. metatranskriptomik) också vad dessa arter har för egenskaper och vilka processer de driver i marken.

Merparten av vår forskning är fältbaserad – vi studerar huvudsakligen organismerna i deras naturliga miljö.

Särskild expertis i gruppen

  • Marksvampars biologi och ekologi.
  • Nordliga barrskogsekosystems funktionella ekologi
  • Arktisk markekologi
  • Markfauna

Clemmensen, K.E., Bahr, A., Ovaskainen, O., Dahlberg, A., Ekblad, A., Wallander, H., Stenlid, J., Finlay, R.D., Wardle, D.A., Lindahl, B.D. 2013. Roots and associated fungi drive long-term carbon sequestration in boreal forest. Science 339: 1615-1618.

Lindahl, B.D., Tunlid A. 2015. Ectomycorrhizal fungi - potential organic matter decomposers, yet not saprotrophs. New Phytologist 205: 1443-1447.

Ihrmark, K., Bödeker, I.T.M., Cruz-Martinez, K., Friberg, H., Kubartova, A., Schenck, J., Strid Y, Stenlid, J., Brandström-Durling, M., Clemmensen, K.E., Lindahl, B.D. 2012. New primers to amplify the fungal ITS2 region – evaluation by 454-sequencing of artificial and natural communities. FEMS Microbiology Ecology 82: 666–677.

Blume-Werry, G., Krab, E.J., Olofsson, J., Sundqvist, M.K., Väisänen, M., Klaminder, J., (2020) Invasive earthworms unlock arctic plant nitrogen limitation. Nature Communications 11 (1), 1766.

Krab, E.J., Oorsprong, H., Berg, M.P., Cornelissen, J.H.C. (2010) Turning northern peatlands upside down: disentangling microclimate and substrate quality effects on vertical distribution of Collembola. Functional Ecology 24, 1362–1369.

Fältarbete inom markbiologi på institutionen för mark och miljö.

Video på fältarbete för ämnesgruppen inom markbiologi på institutionen för mark och miljö.

”Doktorand Erica Packard fryser marken med flytande kväve för att samla in markprover för extraktion av mRNA. Genom att läsa av markens mRNA studerar vi vilka svampar som är aktiva i marken och får en bild av deras samlade genuttryck, vilket ger information om svamparnas egenskaper och aktivitet i olika biokemiska markprocesser.”

Samarbeten

Vi har flera forskningssamarbeten både internationellt och nationellt, bland annat med Oslo univeristet och INRA (French National Research Institute for Agriculture, Food and the Environment) i Frankrike.

Vi samarbetar även aktivt med Naturvårdsverket, Skogsstyrelsen och WWF. Flera stora skogsbolag följer vårt arbete.

Finansiering

Forskningen finansieras i huvudsak av Formas och Vetenskapsrådet.

 

Kontakt