Porträttfoto av Amrei Binzer-Panchal

Amrei Binzer-Panchal

Bioinformatiker, HBIO, Molekylär genetik och bioinformatik
Telefon
+4618671944
Biolog, bioinformatiker och föreståndare av SLU:s bioinformatisk infrastruktur, SLUBI.

Presentation

Jag är biolog och teoretisk ekolog i grunden och är för närvarande föreståndare för SLU:s bioinformatiska infrastruktur (SLUBI). Min bioinformatiska expertis omfattar analys av RNA-sekvensering, metyleringsdata, mikroarraydata, 10x single-cell RNA-sekvensering och automatisering av arbetsflöden.

Vid SLUBI samordnar jag praktiskt datastöd och utbildning inom bioinformatik och hjälper forskare på SLU:s olika campus att hitta relevanta interna och externa resurser.

Jag är intresserad av reproducerbar forskning och av goda rutiner och verktyg som stödjer detta, till exempel Nextflow och arbetsflödesbaserade analysmetoder.

Jag tycker om att utveckla undervisningsmaterial som gör bioinformatik tillgängligt för studenter och forskare på alla nivåer, och att koppla samman människor över ämnesgränser för att stärka den datadrivna forskningen inom livsvetenskaperna vid SLU.

Undervisning

- Plant Biology for Breeding and Protection
- Advanced Plant Breeding and Genetic Resources: Genetic Variation and Breeding Strategies for Sustainable Agriculture
- SIDA training: Bioinformatics for research leaders
- Applied Bioinformatics 
- Analysis of High Throughput Sequencing RNA-Seq Data
- Introduction to Bioinformatics
- Data handling and high-quality illustrations for publications

SLUBI - SLUs bioinformatisk infrastruktur