Tomas Klingström

Min bakgrund är som civilingenjör i molekylär bioteknik och inledningsvis forskade jag med fokus på hur vi bästa ska kunna nyttja information och prover från biobanker. Digitaliseringen av samhället innebär att vi kan samla in allt större datamängder från olika källor och det digitala lantbruket skapar unika förutsättningar för att inte bara studera sjukdomar utan även hur en frisk individ utvecklas och åldras.

Därför leder jag numera arbetet med SLUs infrastruktur för kodata, Gigacow där vi samarbetar med ett stort antal forskare och organisationer i olika projekt där vi genererar stora datamängder i syfte att driva både teknisk utveckling och i detalj studera samspelet mellan arv och miljö hos de kor som lever sina liv på gårdar anslutna till nätverket. Som en del av detta arbete är jag aktiv inom ISOs tekniska kommitté 347 Data-driven agrifood systems och Kunskapsnavet för jordbrukets digitalisering vid Linköpings universitet.

Det långsiktiga målet med min forskning är att kombinera "Big data” (stora datamängder) och olika metoder kopplade till AI (Artificiell Intelligens) med genomisk information i syfte att bättre förstå hur en individ formas av interaktionen mellan arv och miljö. Jag leder Breedmaps-projektet där vi skapar mer detaljerade genetiska kartor för svenska mjölkraser och Seydlitzlaboratoriet för datadriven mjölk- och foderforskning. Seydlitzlaboratoriet utgör en plattform för unga forskare att etablera sig som självständiga forskare med bred kompetens att även stödja andra forskare att använda de data som tillgängliggörs via SLU Gigacow.

Som forskare är jag fokuserad på att arbeta med teknik- och metodutveckling inom ramen för SLU Gigacow och Breedmaps samtidigt som jag är engagerad som partner och stöd till ett stort antal olika projekt.

På SLU undervisar jag på Bioinformatikkursen och doktorandkursen "Reproducibility in Research with a focus on data analysis using the program R".

Därutöver har jag utformat den bioinformatiska grundutbildningen för EU-projektet "Defend 2020 - Addressing the dual emerging threats of African Swine and Lumpy Skin disease" och har arbetat som rådgivare åt FNs Veterinary Diagnostic Laboratory (VETLAB) Network som är en del av IAEA.