Abu Bakar Siddique

Abu är bioinformatiker på SLUBI, en infrastruktur som ger stöd och utbildning i bioinformatik för forskare vid SLU.

Bakgrund

• Sedan juni 2023: Bioinformatiker vid SLU Bioinformatik Infrastructure (SLUBI), Institutionen för växtbiologi, NJ-fakulteten, Sveriges lantbruksuniversitet, Uppsala, Sverige
• 2022–2023: Forskningsingenjör of SLU Bioinformatik Infrastructure(SLUBI), Institutionen för växtbiologi, NJ-fakulteten, Sveriges lantbruksuniversitet, Uppsala, Sverige
• 2022–2023: Förste forskningsingenjör, Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap (EMG), Umeå Universitet, Umeå, Sverige
• 2020–2021: Postdoktor (Forskare), Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap (EMG), Umeå Universitet, Umeå, Sverige
• 2018–2019: Mobilitet Postdoktor (Forskare), Institutionen för virologi, Institutet för växtmolekylärbiologi, Biologiskt centrum CAS, Ceske Budejovice, Tjeckien
• 2013–2017: Doktorand, Institutet för botanik och landskapsekologi, Ernst-Moritz-Arndt universitet (Greifswalds universitet), Greifswald, Tyskland
• 2012–2013: Forskningsassistent, Institutionen för växtfysiologi, UPSC, Umeå Universitet, Sverige

Metabarkodning
Metagenomik
Metatranscriptomik
Mykobiom
Miljö-DNA (eDNA)

• Analys av RNA-Seq-data för högkapacitetssekvensering (doktorandkurs)
• Genomövergripande prediktioner inom avel: genotyp-fenotypassociationer och genomiskt urval (doktorandkurs)
• Datahantering och högkvalitativa illustrationer för publikationer (doktorandkurs)
• Multiomikanalyser av mikrobiella samhällen (doktorandkurs)

Läkare Jonaid Hossain (praktikant, mentor, 2022)
Khan R Salehin (praktikant, bihandledare, 2021)
Abu Bakar Siddique (masteruppsats, bihandledare, 2021)
Anis Mahmud Khokon (magisteruppsats, bihandledare, 2016)