Malin Tiefensee

Jag är doktorand i forskningsgruppen Anaerob Mikrobiell Bioteknik (AMB) vid Institutionen för Molekylära vetenskaper på SLU Uppsala. Min bakgrund är från Uppsala Universitet där jag studerade civilingenjärsprogrammet i molekylär bioteknik innan jag påbörjade mina doktorandstudier år 2023.

Min forskning ligger inom mikrobiologin i biogasprocesser. Jag studerar det steg där olika bakterier och arkéer samarbetar för att kunna använda olika substrat för att producera biometan. Detta sammarbetesförhållande kallas för syntrofi, och jag är speciellt intresserad av intermediärer från nedbrytningsvägar och cycling av kolatomer mellan organismerna. Det övergripande projektet är en upptäcksresa för att precisera syntrofa behov för att optimera produktionssystem inom biometan.

Detta gör jag genom att kombinera mikrobiologi, analytisk kemi och bioinformatik för att bygga en grund för ny kunskap. Mina nuvarande projekt är:

1.     Metagenomkonstruktion och nedbrytningdynamik för en syntrof butyratoxiderande bakterie från en termofil biogasprocess som hittats samarbetande med en syntrof acetatoxiderare och en hydrogenotrof metanogen.

2.    13C-inmärkt acetat och formiat tillsatt till en acetatoxiderande termofil anrikningskultur med ursprung i en termofil biogasprocess. Detta projekt studerar flöde av 13C-atomer med NMR, DNA-SIP och extraktion av intracellulära metaboliter.

3.    13C-inmärkt propionat tillsatt till mesofila och/eller termofila anriktningskulturer. Detta projekt ämnar att studera flöde av 13C-atomer för att etablera kunskap om syntrofa sammarbeten mellan olika syntrofa bakterier och arkéer och hur detta sammarbete kan förändras under tiden huvudsubstratet bryts ner.

4.    Tillsatts av 15N till syntrofa anrikningskulturer och deras reaktionsmekanismer kopplade till ammoniakhämmning.

För tillfället undervisar jag som laboratoriehandledare inom kurserna Genetik, cellbiologi och mikrobiologi med kurskoder BI1440 och BI1421, båda på kandidatnivå.