NextGenHorse: Användning av nästa generations sekvensering för att avkoda hästars kroppsform och rörelsemönster

NextGenHorse är ett tvärvetenskapligt projekt som syftar till att avslöja de genetiska grunderna för hästens kroppsform och rörelser. Även om kroppsbyggnaden spelar en avgörande roll för prestanda, hälsa och rörelseförmåga, har den traditionellt bedömts genom subjektiv visuell utvärdering. Genom att kombinera helgenomsekvensering (WGS) med toppmodern 3D-digital fenotypning introducerar detta projekt en objektiv, datadriven metod för att förstå hästens morfologi (anatomiska likheter och skillnader).

Med hjälp av avancerade verktyg som VAREN 3D-anatomisk modell och markörlösa rörelsefångningssystem kommer vi att generera mycket detaljerade data om kroppsform och rörelseförmåga hos hästar av flera olika raser. Dessa fenotyper kommer att integreras med högupplösta genomdata för att identifiera genetiska varianter som påverkar kroppsbyggnad, gångart och övergripande biomekanisk funktion.

NextGenHorse utforskar också banbrytande analysmetoder, inklusive Genomic Informational Field Theory (GIFT) och multimodala genomiska stora språkmodeller (LLM), för att koppla komplexa genomiska mönster till finfördelade morfologiska egenskaper. I slutändan syftar projektet till att avgöra om en hästs kroppsform kan förutsägas direkt från dess genom.

Genom att kombinera innovativ genomik, datoranatomik och hästbiomekanik kommer NextGenHorse att öka vår förståelse för genotyp-fenotyp-relationer hos hästar och stödja framtida förbättringar inom avel, välfärd och prestationsutvärdering.

Samarbete

Huvudsökande för projektet är är Michela Ablondi, DIPARTIMENTO DI SCIENZE MEDICO-VETERINARIE, Università degli Studi di Parma. I projektet arbetar förutom deltagarna från SLU även Vittoria Asti, University of Parma.