Postdoktor inom genomik på lövträd med fokus på ask (Fraxinus excelsior)

Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi

Vi söker en Postdoktor inom genomik på lövträd  med fokus på ask (Fraxinus excelsior). Askbestånden i stora delar av Europa har i princip slagits ut av askskottsjuka, en sjukdom orsakad av den invasiva svampen Hymenoscyphus fraxineus (ADB). Samtidigt närmar sig smaragdpraktbaggen (Agrilus planipennis, EAB), en mycket allvarlig skadeinsekt som redan orsakat omfattande askdöd i Nordamerika och nu sprider sig i östra Europa. Kombinationen av dessa hot innebär att askens framtid i stora delar av Europa är osäker.

Om jobbet

Att restaurera ask handlar inte enbart om att plantera nya träd. Det kräver kunskap om vilka individer som verkligen är motståndskraftiga, hur genetisk variation kan bevaras, och hur utvalda träd klarar sig under verkliga förhållanden i skogen. En central del av projektet är genetiska analyser. Genom att studera hela arvsmassan hos utvalda träd identifieras genetiska mönster kopplade till resistens mot askskottsjuka och möjlig tolerans mot smaragdpraktbagge. Detta möjliggör utvecklingen av ett kostnadseffektivt DNA-baserat verktyg för att välja lämpligt plantmaterial för förädling och restaurering. Samtidigt analyseras genetisk variation för att säkerställa att restaurering inte sker på bekostnad av långsiktig anpassningsförmåga.

Arbetsuppgifterna fokuserar på genomisk dataanalys dvs analyser från helgenomsekvensering (WGS) av askar med olika resistens mot EAB och ADB för att  identifiera genetiska mekanismer bakom resistens mot de här skadegörarna. Vidare förväntas du stödja utvecklingen av metodik för molekylär analys av resistans, variabilitet, släktskap och genetisk struktur i bevarandeprogrammen. Vidare förväntas du bidra till att utveckla och utvärdera metodik för WGS i alm och artbestämning av alm.

Du förväntas också bidra till FAIR datahantering, versionshantering och reproducerbara analysflöden samt presentera resultaten från ditt arbete i vetenskapliga artiklar och konferenser.

Din bakgrund 

Sökande ska ha doktorsexamen inom växtmolekylärbiologi, eller molekylärgenetik. Gedigna kunskaper inom NGS och tidigare erfarenhet av analys av NGS-data krävs för tjänsten. Tidigare erfarenhet arbete med genetisk variation i ask eller alm är starkt meriterande.

Du skall ha goda kunskaper i engelska samt dokumenterad vetenskaplig publicering i internationella, sakkunniggranskade tidskrifter. Kunskaper i ukrainska är meriterande eftersom delar av projektet utförs i samarbete med forskare i Ukraina.

Anställningen är avsedd för en junior forskare och vi söker därför främst personer som avlagt doktorsexamen för högst tre år sedan. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk tjänstgöring eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag.

Om oss

Institutionen för skogsmykologi och växtpatologi vid SLU har en ledande internationell position inom forskning. Vi bedriver både grundforskning och tillämpad forskning med fokus på de viktiga interaktionerna mellan växter, svampar och andra mikroorganismer i skogs- och jordbrukssystem. Våra viktigaste forskningsområden är skogs- och jordbruksväxtpatologi, växt-jord-mikroorganisminteraktioner, mikrobiell och molekylär ekologi, jämförande genomik och biologisk bekämpning. Vi tar itu med kritiska frågor som förlust av biologisk mångfald, försämrad ekosystemfunktion och effekterna av inhemska och invasiva skadedjur och sjukdomar. Vårt arbete syftar till att utveckla hållbara jordbruks- och skogsbruksmetoder, särskilt med tanke på klimatförändringarna, för att minimera miljöpåverkan och ekonomiska förluster.

Mer information om institutionen/avdelningen: www.slu.se/mykopat

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba vid SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

Placering:

Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi, SLU, Uppsala. 

Anställningsform:

Tidsbegränsad anställning 24 månader, med möjlighet till förlängning beroende på finansiering och projektets utveckling.

Omfattning:

100%

Tillträde:

Snarast

Ansökan:

Ansökan ska innehålla:

• Personligt brev där forskningsbakgrund, erfarenhet, meriter och publikationer beskrivs.
• CV

Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast 2026-10-28

Fackliga kontaktpersoner:

https://internt.slu.se/min-anstallning/facket/kontaktpersoner/

 

Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) har en nyckelroll i utvecklingen för hållbart liv, grundad i vetenskap och utbildning. Genom vårt fokus på samspelen mellan människa, djur och ekosystem och ett ansvarsfullt brukande av naturresurserna bidrar vi till en hållbar samhällsutveckling och goda livsvillkor på vår planet. Huvudorter är Alnarp, Umeå och Uppsala, men verksamhet bedrivs också på forskningsstationer, försöksparker och utbildningsorter i hela landet. SLU har drygt 4000 medarbetare, 6000 studenter och forskarstuderande och en omsättning på över 4,5 miljarder kronor. Universitetet satsar på attraktiva miljöer på sina campusområden. Vi arbetar för en jämställd och inkluderande arbetsmiljö där öppna samtal mellan människor med olika erfarenheter lägger grunden för vetenskaplighet, kreativitet och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och perspektiv att söka den aktuella anställningen.