Anne-Lie Blomström

Jag är forskare vid sektionen för virologi, Institutionen för husdjurens biovetenskaper, Veterinärmedicinska fakulteten, SLU. Min forskning ligger i gränslandet mellan veterinär och jämförande virologi, med särskilt fokus på virus hos djur, leddjursvektorer och vilda värdar, samt deras betydelse för djur- och människors hälsa.

Under de senaste åren har jag lett och deltagit i flera nationella och internationella projekt finansierade av Formas, Vetenskapsrådet (VR) och Stiftelsen Hästforskning. Dessa projekt spänner från viral metagenomik hos produktionsdjur och vilda djur till mekanistiska studier av vektorburna virus och insektsspecifika virus.

Parallellt med min forskning är jag aktiv inom undervisning och handledning på kandidat-, master- och forskarnivå och är koordinator för forskarskolan Graduate School for Veterinary Medicine and Animal Science (GS-VMAS).

Min forskning fokuserar på virusupptäckt och infektionsbiologi, med tre huvudsakliga och sammanlänkade teman:

1. Viral metagenomik och karakterisering av virom
   Jag använder storskaligsekvensering för att kartlägga virussamhällen hos djur och i deras miljö. Detta inkluderar arbete med tarmvirom hos gris och kalv, virom hos häst samt virus i vektorer och vilda värdar (myggor, fästingar och fladdermöss). Dessa studier har lett till upptäckt och genetisk karakterisering av ett flertal tidigare obeskrivna RNA- och DNA-virus och bidrar till ökad förståelse för virusspridning, diversitet, framväxande infektioner och potentiella zoonotiska risker.
2. Vektorburna och insektsspecifika virus
   Ett centralt fokus är arbovirus och insektsspecifika virus (ISVs) hos myggor och andra vektorer. Med hjälp av transkriptomik, små-RNA-sekvensering och omvänd genetik studerar jag hur ISVs och arbovirus interagerar i vektorn och hur detta påverkar vektorers kompetens och transmissionsförmåga. Vi har till exempel visat att en föregående infektion av myggceller med det insektsspecifika Lammi-viruset kan minska replikationen av West Nile-viruset, vilket antyder möjligheter för ISV-baserade kontrollstrategier.
3. Virus-värd-interaktioner och patogenes
   Jag studerar även värdens svar på infektion, bland annat för flavivirus, bunyavirus och andra "emerging"virus. Genom att kombinera cellkulturmodeller med transkriptomik och immunologiska analyser strävar jag efter att förstå hur virus- och värdfaktorer tillsammans påverkar infektionsförlopp, värdtropism och potential för artbarriärsöverskridande smitta.

Jag är aktiv inom undervisning i virologi på flera nivåer. Vid SLU har jag:

Varit modulansvarig för virologidelen i

• VM0113 Allmän sjukdomslära / General mechanisms of disease (Veterinärprogrammet)
• BI1389 Biokemi, cellbiologi och mikrobiologi
• BI1391 Molekylär cellbiologi och mikrobiologi

Utvecklat och varit kursledare för forskarutbildningskursen “Diagnostic preparedness in an outbreak situation” (PVS0078)

Hållit föreläsningar i flera forskarutbildningskurser, inklusive

• Molecular Infection Biology (SLU)
• Mosquito-borne pathogens and their vectors (Umeå universitet)

Jag handleder MSc- och doktorandstudenter, postdoktorer och gästforskare, och organiserar regelbundet virologiska journal clubs och “virology-in-progress”-möten inom sektionen.

Nedan följer tio utvalda originalartiklar publicerade i referee-granskade internationella tidskrifter. Artiklarna är valda för att illustrera olika delar av min forskningsverksamhet. För en fullständig publikationslista i PubMed, klicka här.

Below follows 10 selected published original articles in peer-reviewed international journals. The articles have been selected to show different areas of my research.

1. Blomström AL, Hansen S, Riihimäki M. Identification and whole-genome characterization of a novel equine papillomavirus. Virus Genes. 2025 Oct 23. doi: 10.1007/s11262-025-02190-y.
2. Holst BS, Bonnevie A, Spens J, Lindahl JF, Huupponen A, Syrjä P, Blomström AL. Tick-borne encephalitis virus associated with foetal death in a bitch, a case report. Virology Journal. 2025 Oct 13;22(1):326. doi: 10.1186/s12985-025-02965-7
3. Blomström AL, Källse A, Riihimäki M. Detection and genetic characterization of equine viruses in Sweden using viral metagenomics. BMC Veterinary Research. 2025 Feb 27;21(1):119. doi: 10.1186/s12917-025-04613-2.
4. Bergholm J, Tessema TS, Blomström AL, Berg M. Metagenomic insights into the complex viral composition of the enteric RNA virome in healthy and diarrheic calves from Ethiopia. Virology Journal. 2025 Jun 7;22(1):188. doi: 10.1186/s12985-025-02821-8
5. Cholleti H, de Jong J, Blomström AL, Berg M. Investigation of the Virome and Characterization of Issyk-Kul Virus from Swedish Myotis brandtii Bats. Pathogens. 2022 Dec 21;12(1):12. doi: 10.3390/pathogens12010012.
6. Öhlund P, Delhomme N, Hayer J, Hesson JC, Blomström AL. Transcriptome Analysis of an Aedes albopictus Cell Line Single- and Dual-Infected with Lammi Virus and WNV. International Journal of Molecular Sciences. 2022 Jan 14;23(2):875. doi: 10.3390/ijms23020875.
7. Öhlund P, Hayer J, Hesson JC, Blomström AL. Small RNA Response to Infection of the Insect-Specific Lammi Virus and Hanko Virus in an Aedes albopictus Cell Line. Viruses. 2021 Oct 29;13(11):2181. doi: 10.3390/v13112181.
8. Blomström AL, Luz H.R, Öhlund P, Lukenge M, Brandão P.E, Labruna M.B, Berg M. Novel Viruses Found in Antricola Ticks Collected in Bat Caves in the Western Amazonia of Brazil. Viruses 2020, 12, 48. doi: 10.3390/v12010048
9. Öhlund P, Hayer J, Lundén H, Hesson JC, Blomström AL. Viromics Reveal a Number of Novel RNA Viruses in Swedish Mosquitoes. Viruses. 2019 Nov 5;11(11). pii: E1027. doi: 10.3390/v11111027. 
10. Blomström AL, Quan G, Barry G, Wilkie G, Skelton JK, Baird M, McFarlane M, Schnettler E, Elliott RM, Palmarini M and Kohl A. Transcriptomic analysis reveals the host response to Schmallenberg virus in bovine cells and antagonistic effects of the NSs protein. BMC Genomics. 2015 Apr 19;16(1):324. doi: 10.1186/s12864-015-1538-9