Dirk-Jan de Koning

Om mig

Jag är forskare med ett starkt intresse för den genetiska grunden till variation i komplexa egenskaper – och hur denna kunskap kan användas i avelsprogram. Min forskning omfattar både traditionella djurarter och andra modeller som fisk, möss och växter.

Parallellt med min forskarkarriär har jag lång erfarenhet av akademiskt ledarskap på avdelnings-, institutions- och fakultetsnivå. I mina senaste roller som vice dekan (med ansvar för forskning och forskarutbildning) och prodekan (med övergripande ansvar för forskningsfrågor) har jag arbetat med strategisk utveckling av forskning, långsiktig kompetensförsörjning och akademiska utnämningar. Under 2022 och 2023 ledde jag arbetet med en större omorganisation av fakulteten, som trädde i kraft i början av 2024. Just nu formas de nya institutionerna – med nya arbetssätt, samarbeten och styrformer.

Jag strävar efter ett inkluderande ledarskap där ansvar och beslutsfattande ligger på rätt nivå. Förmågan att förstå och hantera komplexitet är en av mina främsta styrkor.

Sedan den 1 mars 2025 har jag ett nytt uppdrag som vicerektor med ansvar för forskningsinfrastruktur.

Min forskning fokuserar på att koppla DNA-variation till funktionell variation hos husdjur. Jag är särskilt intresserad av experimentell design, dataanalys och bioinformatik. Ett av mina större forskningsprojekt har varit utvecklingen av nya verktyg för molekylär förädling inom ramen för Mistra Biotech.

På djurnivå har jag bedrivit omfattande forskning om benstyrka hos värphöns – ett stort problem inom alla typer av äggproduktionssystem. Parallellt har jag lett flera projekt inom mjölkproduktion, med fokus på råmjölkskvalitet, icke-koagulerande mjölk och genomik kopplad till fruktsamhetsegenskaper. Vi bedriver även pågående forskning inom vattenbruk.

En viktig infrastruktursatsning jag är involverad i är GIGACOW, SLU:s infrastruktur för mjölkdata. Denna infrastruktur är också en del av SUSTAINIMAL, en centrumbildning som undersöker djurens roll i framtidens hållbara livsmedelssystem.

Vid sidan av min forskning är jag aktiv inom det vetenskapliga publiceringssystemet. Jag är senior editor för G3: Genes, Genomes, Genetics, redaktör för Genetics, tidigare redaktör för Heredity, samt verkställande ledamot i Genetics Society (UK).

Utbildning och examina

• 1996, MSC, Wageningen Universitet
• 2001, PHD, Wageningen Universitet

Anställningar

• 2007 - 2010 Band 4 Group Leader*, Roslin Institute
• 2003 - 2007 Career Track Appointment, Roslin Institute
• 2001 - 2003 Post- Doctoral position, Roslin Institute
• 1997 - 2001 PhD Student, Wageningen University
• 1996 – 1997 MTT Agricultural Research Centre of Finland

PhD students, completed:

Suzanne Rowe, Roslin Institute, University of Edinburgh, defended October 2008 (main supervisor).

Alex Lam, Roslin Institute, University of Edinburgh, defended January 2009 (main supervisor).

Claudia Cabrera, Roslin Institute, University of Edinburgh, defended June 2009 (main supervisor).

Cecile Massault, Roslin Institute, University of Edinburgh and Wageningen University, defended July 2010 (co-supervisor).

Zhang Zhe, China Agricultural University, Beijing (co-supervisor), defended 2011

Eva Strucken, Humbolt University, Berlin (Co-supervisor), defended June 2012.

Imran Zahoor, Roslin Institute, University of Edinburgh, (co-supervisor) defended December 2012.

André Hidalgo, SLU and WUR, defended December 2015 (SLU main supervisor)

Bruno Louro, Universidade do Algarve, Faro (co-supervisor), defended 2015

Sandrine Duchémin, SLU and WUR, defended May 2016 (SLU main supervisor)

Xiaowei Mao, Aarhus University and SLU Defended 21 November 2016(SLU main supervisor)

Amabel Tenghe, WUR and SLU, Defended 28 April 2017 (co-supervisor)

Berihu Welderufael, Aarhus University and SLU, Defended 20 November 2017 (main supervisor)

Jovana Marjanovic. WUR and SLU, Defended 20 April 2018 (SLU main supervisor)

Sofia Nyman, SLU, Defended PhD 18 May 2018 (co-supervisor)

Levinus Leonard, UDSM Tanzania, Defended February 2019 (co-supervisor)

Juan Cordero, SLU and WUR (main Supervisor) 28 February 2020

Esinam Amuzu, Wageningen University and SLU (SLU main supervisor) 6 March 2020

Vinicius da Silva, Wageningen University and SLU (co-supervisor) 25 January 2020

Zeratsion Abera Desta, SLU (co-supervisor), 11 November 2020

Redempta Athanas, SLU and UDSM Tanzania, (main supervisor) 4 December 2020

Christer Simon, SLU and UDSM Tanzania, (main supervisor) 24 November 2022

Moses Mbiru, UDSM Tanzania, (co-supervisor) 19 August 2022

Mohammed Sallam, SLU (main supervisor) 7 March 2025

Post-doctoral supervision

Wenhua-Wei, June 2005-May 2009, now lecturer in Statistical Genetic at Manchester University

Suzanne Rowe, October 2008-December 2010. Now Research Lead at Ag-Research New Zealand

Burak Karacaören, January 2008-June 2010, now at University of Akdeniz, Turkey

Javad Nadaf, September 2009-August 2010, now at McGill University, Canada.

Fernando Lopes-Pinto: December 2011- September 2015, now researcher at Olink

Elisabeth Jonas: March 2012-June 2016, now associate professor at SLU

Anna Maria Johansson: January 2013-June 2015, now associate professor at SLU

Sandrine Duchemin: September 2016- December 2018

Elena Mouresan: September 2016-December 2018

Martin Johnsson: March 2017-2022

Kim Jäderkvist: January 2018-April 2018

Sofia Nyman: June 2018-2021

Tomas Klingström: October 2018-2021

Martin Johnsson, Helena Wall, Fernando A Lopes Pinto, Robert H Fleming, Heather A McCormack, Cristina Benavides-Reyes, Nazaret Dominguez-Gasca, Estefania Sanchez-Rodriguez, Ian C Dunn, Alejandro B Rodriguez-Navarro, Andreas Kindmark, Dirk-Jan de Koning, Genetics of tibia bone properties of crossbred commercial laying hens in different housing systems, G3 Genes|Genomes|Genetics, Volume 13, Issue 2, February 2023, jkac302, https://doi.org/10.1093/g3journal/jkac302

Jovana Marjanovic, Han A Mulder, Lars Rönnegård, Dirk‐Jan de Koning, Piter Bijma. 2022. Capturing indirect genetic effects on phenotypic variability: Competition meets canalization. Evoltuionary Application. 15 (4): 694-705.  https://doi.org/10.1111/eva.13353

Banabazi, M.H., Freimanis, G., Goatley, L.C. et al. The transcriptomic insight into the differential susceptibility of African Swine Fever in inbred pigs. Sci Rep 14, 5944 (2024). https://doi.org/10.1038/s41598-024-56569-2

Sallam M, Göransson L, Larsen A, Alhamid W, Johnsson M, Wall H, de Koning D-J and Gunnarsson S (2024) Comparisons of longitudinal radiographic measures of keel bones, tibiotarsal bones, and pelvic bones versus post-mortem measures of keel bone damage in Bovans Brown laying hens housed in an aviary system. Front. Vet. Sci. 11:1432665. doi: 10.3389/fvets.2024.1432665