CV-sida

Gabriella Lindgren

Gabriella Lindgren
Universitetslektor i molekylär husdjursgenetik, sedan juni 2011

Presentation

Jag har alltid varit intresserad av biologi, och började tidigt intressera mig för hästar och genetik. Jag började rida när jag var åtta och har tidigare haft ett svenskt varmblodssto som jag tog två föl från.

Undervisning

Jag är ansvarig för Master- och Forskarutbildningskurserna i Genomanalys och genetikdelen i Biomedicinsk baskurs. Dessutom undervisar jag i genetik på Livsvetenskaplig grundkurs.

Forskning

Hästens gångarter, fysisk prestation och sjukdomar – genetik och genomik

Sverige är det land i Europa som har flest hästar per capita och där ridning är en av de sporter som har flest antal utövare. Hästar avlas för att vara friska, hållbara och för att kunna prestera på topp. Ett viktigt mål med min forskning är att möjliggöra urval av friska och elitpresterande avelsdjur mer exakt. Detta görs genom att identifiera gener och mutationer som styr kritiska fysiska egenskaper.

Jag studerar tamhästar och genetiken som reglerar deras fysiska prestationsegenskaper och rörelsemönster, allergiska eksem och krumma föl (skeletal atavism). I min forskning kombinerar jag både genomik, molekylärgenetik, cell- och beräkningsverktyg samt djurmodeller för att undersöka genvarianter och hur de påverkar fenotypen.

En stor utmaning inom biologin är förklara hur en endimentionell serie av nukleotider kan utgöra hela kartan för en tredimetionell organism. Att bestämma hur generna fungerar och regleras är ett krav för att man ska kunna förstå den processen.

Ganska nyligen har jag även engagerat mig i ett projekt som handlar om grisars exteriör, rörelser och reproduktionsegenskaper.

Bakgrund

Utbildning

Agronomexamen, (MSc) (Bioteknikinriktning), SLU, 1996

Doktorsexamen i Evolutionär genetik, "Genome analysis in the horse". Institutionen för Evolutionsbiologi, Uppsala Universitet, Sverige, 2001.

Docent sedan maj 2009.

Tidigare anställningar och postdoc

  • Forskarassistent 2007 –2011. Institutionen för husdjursgenetik, SLU, Sverige
  • Februari - April 2007. Visiting scientist, Omics Science Center, RIKEN Yokohama Institute, Yokohama, Japan
  • 2004 - 2007. KA Wallenberg Research Fellow (Forskare). Inst. för Medicinsk Biokemi and Mikrobiologi, Uppsala Universitet, Sverige
  • 2002 – 2003. Post doctoral researcher, Department of Genetics, Stanford University School of Medicine, Palo Alto, CA, USA
  • January - February 2002. Visiting scientist, Perlegen Sciences Inc., Mountain View, CA, USA
  • June - December 2001. Forskare, Institutionen för Evolutionsgenetik, Uppsala Universitet, Sverige
  • 1999 – 2001. Doktorand. Institutionen för Evolutionsgenetik, Uppsala Universitet, Sverige
  • 1997 – 1998. Doktorand. Institutionen för husdjursgenetik, SLU, Sverige

Yrkeserfarenhet och utmärkelser

  • Medlem av International Equine Genetic Diversity Consortium
  • Medlem av the Horse Genome Haplotype Committee
  • Vinnare av SKAPA innovationspris (Årets Innovatör) i Uppsala län 2012. Priset delades med Lisa S Andersson och Leif Andersson.
  • En av grundarna av Capilet Genetics, Inc. (grundat 2011)
  • En av flera uppfinnare till det godkända patentet "A method to predict the pattern of locomotion in horses."
  • En av flera uppfinnare till det ansökta patentet: A method to predict skeletal atavism in horses.
  • SLUs förtjänstmedalj i silver. 2015
hastar-i-galopp-2000px.jpg
Fol-i-hage-2000px.jpg

Handledning

Jag är handledare åt två doktorander

  • Kim Jäderkvist Fegraeus. "Identification of genes for locomotion patterns in horses". Huvudhandledare. The Swedish Research Council (VR) and The Swedish Research Council for Environment, Agricultural Sciences and Spatial Planning (FORMAS).
  • Liesbeth François. Biträdande handledare. EC funded project HORSEGENE.

Jag var huvudhandledare för Lisa S. Andersson, som försvarade sin avhandling den 28 september 2012.

Jag var biträdande handledare för Helena Chalkias, som försvarade sin avhandling den 6 december 2013 samt Freyja Imsland som försvarade sin avhandling den 25 september 2015.

Jag var huvudhandledare för Merina Shrestha från augusti 2012 till och med augusti 2015. Merina beräknar försvara sin avhandling i december 2016 där 3 arbeten (artiklar) från min forskargrupp planeras ingå i avhandlingen.

Jag är mentor för en post doc

Brandon D. Velie. EC funded project HORSEGENE

Publikationer i urval

Imsland F, McGowan K, Rubin CJ, Henegar C, Sundström E, Berglund J, Schwochow D, Gustafson U, Imsland P, Lindblad-Toh K, Lindgren G, Mikko S, Millon L, Wade C, Schubert M, Orlando L, Penedo MC, Barsh GS, Andersson L. 2016. Regulatory mutations in TBX3 disrupt asymmetric hair pigmentation that underlies Dun camouflage color in horses. Nat Genet. 2016 Feb;48(2):152-8. doi: 10.1038/ng.3475. Epub 2015 Dec 21.

Kim Jäderkvist, Lisa Johansson, Minna Mäenpää, Anna Mykkänen, Lisa S. Andersson, Brandon D. Velie, Leif Andersson, Thorvaldur Árnason, Gabriella Lindgren. 2015.Different DMRT3 genotypes are best adapted for harness racing and riding in Finnhorses. J Hered. 2015 Nov-Dec;106(6):734-40. doi: 10.1093/jhered/esv062. Epub 2015 Aug 18.

Andersson LS, Larhammar M, Memic F, Wootz H, Schwochow D, Rubin CJ, Patra K, Arnason T, Wellbring L, Hjälm G, Imsland F, Petersen JL, McCue ME, Mickelson JR, Cothran G, Ahituv N, Roepstorff L, Mikko S, Vallstedt A, Lindgren G, Andersson L, Kullander K. (2012). Mutations in DMRT3 affect locomotion in horses and spinal circuit function in mice. Nature. 2012 Aug 30;488(7413):642-6. doi: 10.1038/nature11399.

Wade CM, Giulotto E, Sigurdsson S, Zoli M, Gnerre S, Imsland F, Lear TL, Adelson DL, Bailey E, Bellone RR, Blöcker H, Distl O, Edgar RC, Garber M, Leeb T, Mauceli E, MacLeod JN, Penedo MC, Raison JM, Sharpe T, Vogel J, Andersson L, Antczak DF, Biagi T, Binns MM, Chowdhary BP, Coleman SJ, Della Valle G, Fryc S, Guérin G, Hasegawa T, Hill EW, Jurka J, Kiialainen A, Lindgren G, Liu J, Magnani E, Mickelson JR, Murray J, Nergadze SG, Onofrio R, Pedroni S, Piras MF, Raudsepp T, Rocchi M, Røed KH, Ryder OA, Searle S, Skow L, Swinburne JE, Syvänen AC, Tozaki T, Valberg SJ, Vaudin M, White JR, Zody MC; Broad Institute Genome Sequencing Platform; Broad Institute Whole Genome Assembly Team, Lander ES, Lindblad-Toh K. (2009). Genome sequence, comparative analysis, and population genetics of the domestic horse. Science. 2009 Nov 6;326(5954):865-7. doi: 10.1126/science.1178158.

Lindgren G,  Backstöm N, Swinburne J, Hellborg L, Einarsson A, Sandberg K, Cothran G, Vilà C, Binns MM & Ellegren H. (2004). Limited Number of Patrilines in Horse Domestication. Nature Genetics 36(4): 335-6.


Kontaktinformation
Universitetslektor vid Institutionen för husdjursgenetik (HGEN); Molekylär genetik
Telefon: 018-671918, 070-3280392
Arbetsbeskrivning: Genetics, genomics, horse, disease, athletic performance, locomotion pattern
Postadress:
Inst för Husdjursgenetik, Box 7023
75007 UPPSALA
Besöksadress: Ulls väg 26, Uppsala

Publikationslista: