Biokemi, fortsättningskurs
Biomolekylers och biokemiska reaktionsvägars precision, syfte och logik som skapats under evolutionens gång ligger till grund för alla aspekter av biologiska system såväl som mänskliga aktiviteter. Vetenskapliga framsteg inom biokemi har haft och fortsätter att ha enorm inverkan inom allt ifrån medicin, miljövetenskap, bioteknologi till livsmedelstillverkning. Oberoende av vilken framtida karriärbana du kommer att följa så kommer din kunskap inom biokemi alltid att vara ett nyttigt och t.o.m. även kritiskt viktigt verktyg för att kunna lösa problem.
Snarare än att förse dig med fullständig katalog av biokemisk kunskap (vilket skulle ta flera års studier) så är kursens mål istället att fånga ditt intresse för ämnet biokemi och på så sätt ge dig en mekanistisk förståelse av biologiska fenomen. Dessutom kommer kursen att ge dig bättre förståelse inom nära besläktade fält såsom cellbiologi, immunologi och genetik.
Information från kursledaren
Dear Students,
Welcome to the KE0073 biochemistry course that will start in two weeks!
It is unfortunate to run most of the course on-line (zoom), but this is the policy of our Department that should help counteract the massive spread of covid infection.
Anyway, we, teachers, will do our best that you have fun and have learned new things. You can find the final schedule including zoom link in Files and also on the Home page in Canvas. The passcode to join zoom room is biokemi if you connect from computer or 5013689 if you connect from telephone.
There are only three things which I would like to bother you with at this stage:
1. I've uploaded the latest version of the Course Compendium to Files in Canvas. The compendium provides comprehensive instructions for different modules of the course.
2. For the computer practicals “Molecular Graphics” and “Enzyme Structure” you will need to download PyMOL software in advance. Henrik Hansson have written instructions explaining how to download PyMOL and also other technicalities related to the practicals. The instructions are on pages 10-11 of the Course Compendium
3. And the last but most important, stay safe and healthy:-)
That's all at this stage, I will come back if I've forgot something.
I look forward to meeting all of you at the roll call on the 21st of February.
All the best!
Peter
Kursvärdering
Kursvärderingen är avslutad
KE0073-30177 - Sammanställning av kursvärdering
Efter att kursvärderingen stängt har kursansvarig och studentrepresentanten upp till en månad på sig att skriva kommentarer. De publiceras automatiskt i sammanställningen.
Andra kursvärderingar för KE0073
Läsåret 2023/2024
Biokemi, fortsättningskurs (KE0073-30299)
2024-02-15 - 2024-03-19
Läsåret 2022/2023
Biokemi, fortsättningskurs (KE0073-30062)
2023-02-16 - 2023-03-21
Kursplan och övrig information
Kursplan
KE0073 Biokemi, fortsättningskurs, 7,5 Hp
Biochemistry, continuationÄmnen
Kemi Biologi Kemi BiologiUtbildningens nivå
GrundnivåModuler
| Benämning | Hp | Kod |
|---|---|---|
| Enda modul | 7,5 | 0101 |
Fördjupning
Grundnivå, har mindre än 60 hp kurs/er på grundnivå som förkunskapskravGrundnivå (G1F)
Betygsskala
Kraven för kursens olika betygsgrader framgår av betygskriterier, som ska finnas tillgängliga senast vid kursstart.
Språk
SvenskaFörkunskapskrav
Kunskaper och färdigheter i grundläggande kemi om 15hpMål
Kursens syfte är att ge fördjupade kunskaper och färdigheter inom den molekylära grundvetenskapen biokemi.
Efter genomgången kurs ska studenten kunna:
redogöra översiktligt för olika tekniker för analys och strukturstudier av proteiner
beskriva och exemplifiera principer för enzymkatalys, kinetik och reglering
identifiera strukturella och funktionella delar i proteinstrukturer och relatera till proteinets funktion (t.ex. katalytisk mekanism hos enzymer, receptormekanism)
redogöra översiktligt för metoder för att generera och använda biologisk information (genteknik och bioinformatik)
beskriva hur lipider, kolhydrater och proteiner bryts ned och byggs upp
redovisa och diskutera metabolism i samband med övervikt, näringsintag, träning, svält, diabetes
relatera symptom på underskott/överskott/genetiska defekter till metaboliska störningar på biokemisk nivå
redovisa problemlösning i seminarieform
utföra bearbetning och analys av data från biokemiska experiment samt att skriftligt redovisa dessa
Innehåll
I kursen används föreläsningar, lektioner, datalaborationer, seminarier och övningar. Vissa aktiviteter genomförs i mindre grupper, andra i helklass.
Upprop med kursintroduktion, seminarier, datalaborationer samt gruppövningar är obligatoriska moment. Skriftlig och muntlig framställning övas genom bl.a. redovisning av resultat från datalaborationer, seminarier och gruppövningar.
Kursen består både av biokemisk teori och av arbete med biokemisk problemlösning.
Följande ämnen behandlas under föreläsningar, lektioner, seminarier, datalaborationer och övningar:
tekniker för rening, analys och strukturstudier av proteiner
genteknik, bioinformatik, "omics" (genomik, transcriptomik, proteomik, metabolomik), rekombinant genexpression
enzymer: katalytiska mekanismer, reglering av aktivitet, allosteri, effektivitet, specificitet, enzym-assays
kolhydratmetabolism: pentos-fosfatvägen, glukoneogenes, glykogen, reciprok reglering
metabolism av fetter, lipider, aminosyror, proteiner, nukleotider, kvävemetabolism
integrering av metabolism: näringsintag, homeostas, hormonell kontroll, kroppsvikt, BMI, övervikt, träning, svält, alkohol
membrankanaler, pumpar, signaltransduktion, sensoriska system, receptorer
Betygsformer
Kraven för kursens olika betygsgrader framgår av betygskriterier, som ska finnas tillgängliga senast vid kursstart.Examinationsformer och fordringar för godkänd kurs
Examinationsformer: Skriftlig tentamen och obligatoriska moment.
För att bli godkänd på kursen krävs: Godkänd tentamen samt godkänt deltagande i obligatoriska moment.
- Examinatorn har, om det finns skäl och är möjligt, rätt att ge en kompletteringsuppgift till den student som inte blivit godkänd på en examination.
- Om studenten har ett beslut från SLU om riktat pedagogiskt stöd på grund av funktionsnedsättning, kan examinatorn ge ett anpassat prov eller låta studenten genomföra provet på ett alternativt sätt.
- Om denna kursplan läggs ned, ska SLU besluta om övergångsbestämmelser för examination av studenter, som antagits enligt denna kursplan och ännu inte blivit godkända.
- För examination av självständigt arbete (examensarbete) gäller dessutom att examinatorn kan tillåta studenten att göra kompletteringar efter inlämningsdatum. Mer information finns i utbildningshandboken.
Övriga upplysningar
- Rätten att delta i undervisning och/eller handledning gäller endast det kurstillfälle, som studenten blivit antagen till och registrerad på.
- Om det finns särskilda skäl, har studenten rätt att delta i moment som kräver obligatorisk närvaro vid ett senare kurstillfälle. Mer information finns i utbildningshandboken.
Ytterligare information
Förkunskapskraven kan uppnås t.ex. genom att ha följt kurserna i grundläggande kemi I och II om totalt 22,5 hp med minst 15 hp godkänt resultat.Enstaka kursmoment kan komma att genomföras på engelska.
Ansvarig institution/motsvarande
Institutionen för molekylära vetenskaper
Kompletterande uppgifter
Betygskriterier
After completion of the course students should be able to:
- Examine and explain the relationships between structure of a macromolecule, especially of a protein, its biochemical activity and its functional role in a particular biochemical pathway.
- Examine and explain the role of a particular biochemical pathway in normal development and disease, at the cellular and organismal levels.
- Discuss basic metabolism and integrate major metabolic processes into health and disease states.
|
Learning goal |
Grading criteria |
||
|
3 (G) |
4 (VG) |
5 (MVG) |
|
|
1 |
Describe how protein activity can be regulated by altering its structure. |
Describe and illustrate how protein activity and the whole biochemical pathway can be regulated by altering protein structure. |
Correlate protein structure, protein activity and biochemical pathway in the context of normal development and disease, at the cellular and organismal levels. |
|
2 |
Describe the role of basic biochemical pathways in normal development and disease. |
Connect cellular and organismal roles of biochemical pathways in the context of normal development and disease. |
|
|
3 |
Describe major metabolic processes and how they are regulated. |
Compare major metabolic processes in health versusdisease. |
Reflect on health and disease states from metabolome viewpoint. |
NB! All compulsory parts of the course should be fulfilled for all grades; i.e. participation in all computer practicals, group exercises, invited seminars and student seminar presentations.
Litteraturlista
- Biochemistry Författare: J.M. Berg, J.L. Tymoczko, G.J. Gatto, Jr., L. Stryer ISBN: 978-1-319-11467-1 [Biochemistry] (https://www.macmillanlearning.com/college/us/product/Biochemistry/p/1319114679) Kommentar: Sidhänvisningar ges till senaste upplagan 9th edition. Tidigare upplagor 8th och 7th ed fungerar också.